87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2037 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 325 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  86.15 
 
 		 325 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  62.5 
 
 		 322 aa  358  5e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  60.87 
 
 		 322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  63.49 
 
 		 318 aa  349  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  55.91 
 
 		 326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  62.97 
 
 		 323 aa  299  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  51.91 
 
 		 323 aa  256  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  54.29 
 
 		 325 aa  238  9e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  41.25 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  46.33 
 
 		 317 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  47.6 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  47.44 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  41.61 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  45.13 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  44.41 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  44.34 
 
 		 336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  39.17 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  43.81 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  43.09 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  43.09 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  43.09 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  43.77 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  39.31 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  46.28 
 
 		 345 aa  159  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  48.87 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  43.28 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  43.6 
 
 		 247 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  43.6 
 
 		 247 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  45.76 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  41.43 
 
 		 332 aa  132  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  42.77 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  41.88 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  43.48 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  37.03 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  43.48 
 
 		 323 aa  99.4  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  27.96 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  27.96 
 
 		 321 aa  86.3  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  29.09 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  26.97 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  28.52 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  29.15 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  27.96 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  28.73 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  28.73 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  28.36 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  30.99 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  29.66 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  29.97 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  33.71 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  25.41 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  25.08 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3083  arsenical-resistance protein  25.48 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4422  arsenical-resistance protein  25.48 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  42.79 
 
 		 255 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  28.81 
 
 		 389 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  25.51 
 
 		 322 aa  49.3  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6114  arsenical-resistance protein  23.67 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1810  arsenical-resistance protein  22.68 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324178  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  27.35 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  28.97 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  26.21 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  27.4 
 
 		 365 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0139  hypothetical protein  19.69 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  26.75 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3146  arsenical-resistance protein  24.18 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  24.51 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  30.52 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  22.26 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  31.86 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  23.19 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  23.39 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  31.86 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  30 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  31.86 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  27.85 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  28.48 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  31.87 
 
 		 377 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  26.52 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  27.1 
 
 		 381 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  26.9 
 
 		 350 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  26.77 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  24.62 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  24.62 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14670  arsenical-resistance protein  28.12 
 
 		 371 aa  42.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  26.21 
 
 		 350 aa  42.7  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  25.19 
 
 		 345 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>