More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2444 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2444  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 170 aa  346  8e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  36.81 
 
 		 162 aa  117  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.97 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.65 
 
 		 179 aa  110  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  37.13 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.55 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  34.97 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.97 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  34.73 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  38.36 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  36.08 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  37.11 
 
 		 181 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  37.11 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  36.53 
 
 		 161 aa  103  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.51 
 
 		 173 aa  103  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.61 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  37.95 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  38.85 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  36.42 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  35 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  38.1 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.49 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.03 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.22 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  33.54 
 
 		 164 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11371  Holliday junction resolvase  33.74 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.925664 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  38.36 
 
 		 181 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  39.24 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  32.93 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1822  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.21855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  31.74 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.27 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  38.89 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  36.31 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  37.72 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  36.9 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  37.13 
 
 		 186 aa  98.2  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4063  Holliday junction resolvase  39.86 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.93 
 
 		 191 aa  96.7  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  41.03 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  37.65 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  40.25 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  41.03 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  41.03 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1854  Holliday junction resolvase  36.59 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  36.97 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  40.38 
 
 		 173 aa  95.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.94 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  41.03 
 
 		 173 aa  95.1  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 157 aa  94.4  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.13 
 
 		 174 aa  94  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  32.52 
 
 		 165 aa  94  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 182 aa  94  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  39.87 
 
 		 168 aa  94  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0002  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.34 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.075802  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.5 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.33 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0008  Holliday junction endonuclease RuvC  32.1 
 
 		 156 aa  93.2  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  34.55 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  33.33 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  38.27 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.8 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  36.81 
 
 		 182 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  38.65 
 
 		 157 aa  92.4  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  39.38 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.59 
 
 		 158 aa  92  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2011  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.32 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  35.15 
 
 		 157 aa  92  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  36.48 
 
 		 180 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  36.48 
 
 		 183 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  37.11 
 
 		 180 aa  91.3  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  39.35 
 
 		 173 aa  91.3  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0026  Holliday junction resolvase  35.9 
 
 		 160 aa  91.3  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580095  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2057  Holliday junction resolvase  35.44 
 
 		 157 aa  91.3  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  36.48 
 
 		 183 aa  91.3  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1897  Holliday junction resolvase  35.9 
 
 		 160 aa  90.9  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  32.1 
 
 		 156 aa  90.9  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  38.61 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  38.36 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.32 
 
 		 191 aa  90.1  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2104  Holliday junction resolvase  33.33 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  34.55 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  35.85 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  35.85 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.09 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  38.13 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2104  Holliday junction resolvase  36.54 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  36.08 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  38.13 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  36.59 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  38.13 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>