234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1448 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 373 aa  758    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  55.44 
 
 		 381 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  57.22 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  56.95 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  53.28 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  56.15 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  54.84 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  57.26 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  53.68 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  56.71 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  50.4 
 
 		 387 aa  364  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  50 
 
 		 387 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  50.13 
 
 		 403 aa  363  4e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  54.3 
 
 		 372 aa  362  8e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  50.13 
 
 		 387 aa  359  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  51.96 
 
 		 409 aa  358  9e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  52.07 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  53.55 
 
 		 393 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  51.38 
 
 		 395 aa  354  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  52.21 
 
 		 392 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  53.02 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  52.6 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  51.37 
 
 		 372 aa  348  7e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  51.6 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  51.12 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  51.12 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  46.68 
 
 		 387 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  48.81 
 
 		 382 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  49.86 
 
 		 358 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  51.72 
 
 		 377 aa  335  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  46.68 
 
 		 386 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  52.34 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  50.28 
 
 		 389 aa  332  5e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  51.1 
 
 		 394 aa  332  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  50.14 
 
 		 354 aa  332  9e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  52.43 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  49.31 
 
 		 368 aa  327  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  50.28 
 
 		 358 aa  326  5e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  46.37 
 
 		 404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  48.92 
 
 		 371 aa  309  5e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  42.63 
 
 		 403 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  45.23 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  45.98 
 
 		 365 aa  291  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  42.93 
 
 		 367 aa  291  9e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  43.73 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  40.58 
 
 		 371 aa  288  8e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  45.53 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  45.53 
 
 		 365 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  44.17 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  41.85 
 
 		 377 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  41.58 
 
 		 367 aa  285  7e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  41.62 
 
 		 368 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  45.4 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  41.58 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  43.09 
 
 		 366 aa  282  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  40.54 
 
 		 370 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  45.13 
 
 		 365 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  44.85 
 
 		 383 aa  282  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  44.67 
 
 		 365 aa  281  9e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  44.08 
 
 		 365 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  39.57 
 
 		 368 aa  281  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  43.7 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  44.38 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  45.4 
 
 		 365 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  43.73 
 
 		 365 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  45.4 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  45.4 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  45.13 
 
 		 365 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  42.35 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  44.48 
 
 		 360 aa  279  7e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  44.2 
 
 		 366 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  45.11 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  40.43 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  43.15 
 
 		 365 aa  278  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  42.02 
 
 		 393 aa  276  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  44.83 
 
 		 366 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  40.11 
 
 		 373 aa  276  5e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  44.83 
 
 		 366 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  40.81 
 
 		 372 aa  276  5e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  44.83 
 
 		 366 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  44.83 
 
 		 366 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  41.8 
 
 		 364 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  41.53 
 
 		 364 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  44.83 
 
 		 366 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  40.7 
 
 		 365 aa  275  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  41.8 
 
 		 364 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  44.83 
 
 		 366 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  44.83 
 
 		 365 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  40.48 
 
 		 368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  40.11 
 
 		 373 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  42.27 
 
 		 365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  42.66 
 
 		 367 aa  273  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  41.3 
 
 		 366 aa  272  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  43.27 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  41.76 
 
 		 360 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  40.27 
 
 		 368 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  42.54 
 
 		 367 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  39.67 
 
 		 367 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  42.54 
 
 		 367 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  41.3 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>