233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2945 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 409 aa  835    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  64.15 
 
 		 387 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  61.64 
 
 		 387 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  61.38 
 
 		 386 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  62.73 
 
 		 387 aa  478  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  62.2 
 
 		 403 aa  474  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  61.33 
 
 		 387 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  58.58 
 
 		 392 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  52.63 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  55.92 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  53.49 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  53.87 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  53.68 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  57.54 
 
 		 416 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  56.01 
 
 		 410 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  53.87 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  52.86 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  52.76 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  49.87 
 
 		 403 aa  366  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  53.02 
 
 		 404 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  50.4 
 
 		 393 aa  362  9e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  51.09 
 
 		 390 aa  360  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  49.73 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  50 
 
 		 395 aa  346  4e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  51.96 
 
 		 373 aa  345  6e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  51.52 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  48.7 
 
 		 381 aa  333  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  47.18 
 
 		 372 aa  315  7e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  42.82 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  44.66 
 
 		 358 aa  297  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  47.85 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  45.34 
 
 		 377 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  45.45 
 
 		 358 aa  292  7e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  45.45 
 
 		 358 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  43.4 
 
 		 368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  43.53 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  44.63 
 
 		 358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  45.58 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  44.01 
 
 		 389 aa  278  9e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  42.01 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  45.05 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  40.83 
 
 		 393 aa  260  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2542  predicted protein  37.5 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  39.95 
 
 		 391 aa  256  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  41.58 
 
 		 360 aa  255  9e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  39.34 
 
 		 372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  41.42 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  40.16 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  40.33 
 
 		 374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  40.4 
 
 		 377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  41.9 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  38.5 
 
 		 374 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  41.44 
 
 		 367 aa  249  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  41.13 
 
 		 364 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  41.13 
 
 		 364 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  37.67 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  40.49 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  41.01 
 
 		 364 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  41.64 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  38.52 
 
 		 373 aa  246  4e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  38.78 
 
 		 375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  39.01 
 
 		 374 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  39.78 
 
 		 383 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  39.05 
 
 		 374 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  39.34 
 
 		 374 aa  245  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  41.23 
 
 		 366 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  40.05 
 
 		 383 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  38.67 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  38.5 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  38.67 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  38.23 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  38.67 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  38.5 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  38.62 
 
 		 374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  38.67 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  39.89 
 
 		 364 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  40.06 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  39.95 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  40.85 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  37.95 
 
 		 383 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  38.23 
 
 		 375 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  38.87 
 
 		 365 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  38.27 
 
 		 368 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  39.94 
 
 		 365 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  38.68 
 
 		 371 aa  242  9e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  40.51 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  40.17 
 
 		 371 aa  242  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  38.96 
 
 		 367 aa  242  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  36.78 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  38.36 
 
 		 374 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  38.96 
 
 		 367 aa  242  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  39.61 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  39.77 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  40.88 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  37.6 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  39.61 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  39.77 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  39.77 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  39.77 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  39.77 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>