237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_2542 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_2542  predicted protein  100 
 
 		 417 aa  867    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  37.5 
 
 		 409 aa  260  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  41.62 
 
 		 373 aa  249  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  38.24 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  42.86 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  35.73 
 
 		 387 aa  243  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  44.17 
 
 		 416 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  42.2 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  42.81 
 
 		 386 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  37.5 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  35.25 
 
 		 403 aa  239  9e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  39.46 
 
 		 381 aa  236  7e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  37.26 
 
 		 410 aa  236  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  35.58 
 
 		 393 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  35.9 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  36.52 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  41.43 
 
 		 387 aa  234  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07029  mitochondrial ATPase (Afg1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04130)  35 
 
 		 653 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  40.06 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01350  hypothetical protein  33.77 
 
 		 521 aa  231  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  39.14 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  38.7 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  35.97 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  37.26 
 
 		 377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  35.1 
 
 		 404 aa  226  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  33.89 
 
 		 387 aa  226  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  35.1 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  34.3 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  39.94 
 
 		 393 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  39.88 
 
 		 372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3538  predicted protein  40.06 
 
 		 319 aa  222  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.366937  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  35.77 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  38.89 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  41.72 
 
 		 371 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  33.65 
 
 		 403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  39.46 
 
 		 372 aa  217  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  38.87 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  39.06 
 
 		 358 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  39.63 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  39.33 
 
 		 395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  39.06 
 
 		 358 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  38.8 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  34.13 
 
 		 360 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22398  predicted protein  37.78 
 
 		 378 aa  209  8e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  37.65 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  38.72 
 
 		 379 aa  200  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  37.58 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  31.65 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  37.89 
 
 		 375 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  37.89 
 
 		 375 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  33.98 
 
 		 358 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  31.41 
 
 		 376 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  34.61 
 
 		 360 aa  196  6e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  38.2 
 
 		 375 aa  195  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  37.27 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  37.27 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  37.27 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  37.27 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  37.27 
 
 		 374 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  34.97 
 
 		 367 aa  193  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  33.49 
 
 		 375 aa  192  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  32.78 
 
 		 391 aa  192  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  36.96 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  35.57 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  38.27 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  36.96 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  36.96 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  31.18 
 
 		 367 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  33.73 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  32.3 
 
 		 366 aa  190  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  36.72 
 
 		 371 aa  190  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  35.58 
 
 		 374 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  31.34 
 
 		 365 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  31.97 
 
 		 368 aa  189  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  31.04 
 
 		 367 aa  189  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  34.47 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  34.47 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  34.47 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  30.64 
 
 		 366 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  36.96 
 
 		 374 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  33.73 
 
 		 388 aa  186  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  36.89 
 
 		 373 aa  186  8e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  33.97 
 
 		 386 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  31.19 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  34.16 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  31.19 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  33.73 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  37.31 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  34.6 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  36.86 
 
 		 367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2359  AFG1-family ATPase  37.04 
 
 		 358 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  33.65 
 
 		 368 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  36.67 
 
 		 368 aa  183  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  33.96 
 
 		 376 aa  182  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  36.09 
 
 		 373 aa  182  7e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  35.09 
 
 		 365 aa  182  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  34.6 
 
 		 365 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  35.71 
 
 		 372 aa  182  9.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  31.34 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  31.74 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>