234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1626 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  100 
 
 
371 aa  743    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  52.59 
 
 
404 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  48.79 
 
 
393 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  48.55 
 
 
381 aa  313  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  48.27 
 
 
390 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  48.53 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  47.34 
 
 
395 aa  308  8e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  46.01 
 
 
382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  47.72 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  48.5 
 
 
358 aa  306  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  48.92 
 
 
373 aa  305  8.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  47.06 
 
 
368 aa  299  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  48.93 
 
 
397 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  46.83 
 
 
377 aa  295  8e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  46.11 
 
 
394 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  45.38 
 
 
387 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  47.87 
 
 
379 aa  292  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  48.26 
 
 
394 aa  289  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  50.64 
 
 
372 aa  288  9e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  45.53 
 
 
358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  47.45 
 
 
394 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  45.45 
 
 
358 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  45.53 
 
 
358 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  47.45 
 
 
404 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  45.45 
 
 
395 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  46.92 
 
 
372 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  48.26 
 
 
416 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  52.38 
 
 
389 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  47.18 
 
 
397 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  45.71 
 
 
354 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  43.09 
 
 
371 aa  276  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  48.53 
 
 
410 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  44.93 
 
 
392 aa  276  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  45.05 
 
 
409 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  43.6 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  42.82 
 
 
387 aa  272  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  42.78 
 
 
386 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  42.28 
 
 
403 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  41.35 
 
 
387 aa  266  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  46.65 
 
 
404 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  46.38 
 
 
404 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  41.55 
 
 
375 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  41.55 
 
 
375 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  41.55 
 
 
375 aa  260  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  43.9 
 
 
360 aa  258  8e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  39.62 
 
 
368 aa  256  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  38.3 
 
 
403 aa  250  3e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  41.4 
 
 
371 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  41.32 
 
 
367 aa  249  7e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  42.17 
 
 
365 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  39.95 
 
 
374 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  37.9 
 
 
371 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  41.43 
 
 
365 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  40.5 
 
 
367 aa  245  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  39.68 
 
 
374 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  40.11 
 
 
365 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  39.68 
 
 
374 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  39.84 
 
 
365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  39.68 
 
 
374 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  42.45 
 
 
365 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  42.45 
 
 
365 aa  242  9e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  42.45 
 
 
365 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  42.74 
 
 
366 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  42.17 
 
 
365 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  41.88 
 
 
383 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  42.74 
 
 
366 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  42.17 
 
 
365 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  42.17 
 
 
365 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  42.74 
 
 
366 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  42.74 
 
 
366 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  42.74 
 
 
365 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  40.85 
 
 
367 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  42.74 
 
 
366 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  41.6 
 
 
366 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  39.84 
 
 
374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  40.93 
 
 
365 aa  240  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  40.86 
 
 
365 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  38.25 
 
 
377 aa  239  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  41.88 
 
 
365 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  40.27 
 
 
367 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07029  mitochondrial ATPase (Afg1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04130)  38.8 
 
 
653 aa  237  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  41.6 
 
 
365 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  40.21 
 
 
374 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  41.46 
 
 
365 aa  235  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  39.61 
 
 
366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  38.95 
 
 
376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  41.03 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  40.38 
 
 
366 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  37.87 
 
 
368 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  41.16 
 
 
369 aa  233  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  43.05 
 
 
372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  44.55 
 
 
366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  38.24 
 
 
383 aa  232  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  40.76 
 
 
361 aa  233  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  40.16 
 
 
367 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  39.33 
 
 
367 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  38.03 
 
 
372 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  37.8 
 
 
376 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  35.5 
 
 
372 aa  230  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  39.66 
 
 
367 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>