232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4843 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  100 
 
 
372 aa  749    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  53.91 
 
 
381 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  51.23 
 
 
373 aa  352  8e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  48.14 
 
 
372 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  50.28 
 
 
358 aa  334  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  51.89 
 
 
416 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  48.01 
 
 
395 aa  331  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  50.4 
 
 
397 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  48.66 
 
 
368 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  48.27 
 
 
379 aa  328  6e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  49.2 
 
 
393 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  47.86 
 
 
395 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  46.49 
 
 
358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  46.49 
 
 
358 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  47.59 
 
 
387 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  47.59 
 
 
387 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  45.92 
 
 
390 aa  316  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  47.87 
 
 
393 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  45.97 
 
 
358 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  47.06 
 
 
403 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  46.48 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  48.01 
 
 
397 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  46.01 
 
 
387 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  48.01 
 
 
410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  47.66 
 
 
389 aa  306  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  45.6 
 
 
387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  47.5 
 
 
354 aa  305  6e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  47.41 
 
 
409 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  46.13 
 
 
386 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  46.07 
 
 
377 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  48.4 
 
 
394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  47.37 
 
 
404 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  46.63 
 
 
393 aa  302  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  48.27 
 
 
394 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  48.13 
 
 
404 aa  298  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  48.13 
 
 
404 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  40.87 
 
 
403 aa  288  2e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  46.28 
 
 
371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  42.93 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  49.22 
 
 
392 aa  279  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  42.89 
 
 
382 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  43.32 
 
 
371 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  39.27 
 
 
374 aa  261  8.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  43.78 
 
 
371 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  40.47 
 
 
374 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  40.47 
 
 
374 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  39.27 
 
 
375 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  40.21 
 
 
374 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  39.27 
 
 
375 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  39.27 
 
 
375 aa  256  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  39.79 
 
 
374 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  38.74 
 
 
375 aa  255  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  38.74 
 
 
375 aa  255  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  38.74 
 
 
375 aa  255  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  38.74 
 
 
375 aa  255  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  38.48 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  39.95 
 
 
374 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  43.01 
 
 
360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  38.74 
 
 
375 aa  252  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  39.08 
 
 
367 aa  252  7e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  40.38 
 
 
367 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  41.13 
 
 
372 aa  249  7e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  37.2 
 
 
367 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  39.52 
 
 
370 aa  247  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  40.32 
 
 
370 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  36 
 
 
383 aa  245  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  40.05 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  37.47 
 
 
367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  37.74 
 
 
371 aa  243  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  40.05 
 
 
370 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  40.05 
 
 
370 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  40.32 
 
 
365 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  40.32 
 
 
365 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  39.14 
 
 
368 aa  243  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  36.27 
 
 
383 aa  242  9e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  42.2 
 
 
365 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  40.32 
 
 
366 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  37.2 
 
 
370 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  39.62 
 
 
388 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  39.35 
 
 
386 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  39.35 
 
 
386 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  40.76 
 
 
365 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  39.18 
 
 
361 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  39.52 
 
 
369 aa  239  8e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  36.9 
 
 
365 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  37.29 
 
 
372 aa  237  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  35.73 
 
 
376 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  38.71 
 
 
370 aa  237  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  40.53 
 
 
365 aa  237  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  37.3 
 
 
373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  40.58 
 
 
393 aa  235  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  36.49 
 
 
373 aa  235  9e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  38.08 
 
 
366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  38.81 
 
 
365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  39.19 
 
 
364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  38.92 
 
 
364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  39.89 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  37.97 
 
 
368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  39.89 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  39.89 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>