234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2324 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  100 
 
 		 377 aa  772    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  69.6 
 
 		 372 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  69.23 
 
 		 379 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  51.72 
 
 		 373 aa  332  8e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  48.96 
 
 		 381 aa  321  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  48.83 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  48.29 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  49.08 
 
 		 395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  48.57 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  47.92 
 
 		 416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  47.73 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  45.5 
 
 		 409 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  46.07 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  47.01 
 
 		 382 aa  295  8e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  44.99 
 
 		 389 aa  289  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  47.14 
 
 		 404 aa  288  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  46.42 
 
 		 393 aa  288  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  45.45 
 
 		 397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  46.83 
 
 		 371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  45.3 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  45.55 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  45.34 
 
 		 404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  45.14 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  45.45 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  45.5 
 
 		 387 aa  279  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  45.03 
 
 		 358 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  45.58 
 
 		 358 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  45.48 
 
 		 410 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  45.17 
 
 		 393 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  46.34 
 
 		 404 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  46.34 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  44.76 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  42.89 
 
 		 387 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  42.59 
 
 		 403 aa  272  6e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  41.95 
 
 		 387 aa  272  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  42.45 
 
 		 387 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  42.15 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  44.08 
 
 		 354 aa  264  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  41.58 
 
 		 392 aa  263  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  41.78 
 
 		 394 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  42.43 
 
 		 360 aa  258  8e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  38.34 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  39.39 
 
 		 403 aa  257  2e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  38.07 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  41.82 
 
 		 371 aa  255  9e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  41.19 
 
 		 365 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  38.34 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  38.4 
 
 		 367 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  40.54 
 
 		 365 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  39.84 
 
 		 365 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  40.38 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  40.96 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  39.78 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  40.5 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  40.26 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  40.38 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  38.7 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  40.88 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  39.84 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  40.27 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  40.86 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  40.86 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  41.08 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  37.8 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  40.27 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  40.86 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  40.86 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  41.32 
 
 		 365 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  40.16 
 
 		 374 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  37.87 
 
 		 370 aa  239  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  40.86 
 
 		 366 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  40.86 
 
 		 366 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  40.77 
 
 		 365 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  40.77 
 
 		 365 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  40.77 
 
 		 365 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  39.69 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  38.64 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  42.54 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  41.05 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  40.61 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  38.54 
 
 		 375 aa  237  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  38.54 
 
 		 375 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  38.54 
 
 		 375 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  41.82 
 
 		 360 aa  237  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  39.68 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  40.32 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  39.68 
 
 		 366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  37.5 
 
 		 383 aa  236  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  39.32 
 
 		 374 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  37.33 
 
 		 367 aa  235  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  39.95 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  40.48 
 
 		 361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  39.89 
 
 		 386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  37.07 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  39.47 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  38.24 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  39.3 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  38.54 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  38.64 
 
 		 375 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  39.47 
 
 		 370 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>