234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2159 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 397 aa  796    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  90.18 
 
 		 416 aa  707    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  71.87 
 
 		 410 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  70.59 
 
 		 404 aa  521  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  69.64 
 
 		 404 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  69.39 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  60.26 
 
 		 390 aa  458  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  59.39 
 
 		 393 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  58.81 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  59.17 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  57.37 
 
 		 387 aa  418  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  57.1 
 
 		 403 aa  418  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  57.76 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  56.1 
 
 		 394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  59.22 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  54.16 
 
 		 387 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  59.05 
 
 		 397 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  57.22 
 
 		 373 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  56.09 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  57.61 
 
 		 394 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  54.77 
 
 		 387 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  55.19 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  55.92 
 
 		 409 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  52.38 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  51.32 
 
 		 386 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  47.27 
 
 		 403 aa  354  2e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  52.72 
 
 		 381 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  50.92 
 
 		 372 aa  326  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  50.4 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  51.57 
 
 		 379 aa  323  4e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  49.18 
 
 		 368 aa  322  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  50.41 
 
 		 358 aa  320  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  48.83 
 
 		 377 aa  316  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  49.04 
 
 		 358 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  49.04 
 
 		 358 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  46.54 
 
 		 382 aa  307  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  49.31 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  48.53 
 
 		 389 aa  305  9.000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  45.27 
 
 		 404 aa  295  8e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  43.87 
 
 		 371 aa  289  6e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  42.59 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  46.13 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  40.43 
 
 		 367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  44.17 
 
 		 371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  44.99 
 
 		 360 aa  282  9e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  42.78 
 
 		 364 aa  278  9e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  40.48 
 
 		 367 aa  277  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  42.51 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  42.82 
 
 		 364 aa  276  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  41.67 
 
 		 374 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  42.13 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  41.42 
 
 		 364 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  41.22 
 
 		 364 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  41.22 
 
 		 364 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  43.62 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  47.18 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  40.69 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  42.74 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  40.69 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  42.74 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  42.47 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  39.67 
 
 		 372 aa  269  5e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  44.62 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  40.86 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  41.89 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  41.81 
 
 		 339 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  41.89 
 
 		 370 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  38.2 
 
 		 373 aa  265  8e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  40.7 
 
 		 370 aa  265  8e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  41.89 
 
 		 370 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  38.2 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  41.62 
 
 		 370 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  40.21 
 
 		 368 aa  263  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  39.52 
 
 		 383 aa  262  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  38.86 
 
 		 368 aa  262  8e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  37.47 
 
 		 368 aa  262  8.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  41.89 
 
 		 370 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  39.01 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  40.27 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  45.6 
 
 		 372 aa  259  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  39.21 
 
 		 375 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  40.62 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  38.93 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  38.42 
 
 		 383 aa  257  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  39.68 
 
 		 376 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  38.9 
 
 		 375 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  38.9 
 
 		 375 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  38.9 
 
 		 375 aa  256  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  40.32 
 
 		 361 aa  256  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  41.22 
 
 		 393 aa  256  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  40.97 
 
 		 370 aa  256  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  39.51 
 
 		 367 aa  255  9e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  38.95 
 
 		 375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  43.27 
 
 		 367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  38.95 
 
 		 375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  38.95 
 
 		 375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  38.95 
 
 		 375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  40 
 
 		 374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  38.68 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  39.13 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>