234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0391 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 393 aa  808    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  73.86 
 
 		 393 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  73.47 
 
 		 393 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  73.1 
 
 		 394 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  74.62 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  73.8 
 
 		 397 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  67.09 
 
 		 394 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  58.81 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  60.42 
 
 		 410 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  57.62 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  56.4 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  58.03 
 
 		 416 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  56.48 
 
 		 395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  56.09 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  56.09 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  53.48 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  53.21 
 
 		 403 aa  391  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  53.39 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  52.41 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  52.99 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  49.06 
 
 		 387 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  50.4 
 
 		 409 aa  362  8e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  49.33 
 
 		 386 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  52.1 
 
 		 387 aa  355  5e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  52.07 
 
 		 373 aa  344  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  45.29 
 
 		 403 aa  325  7e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  46.19 
 
 		 381 aa  323  3e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  44.16 
 
 		 404 aa  308  9e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  46.56 
 
 		 358 aa  295  7e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  47.72 
 
 		 371 aa  295  8e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  47.37 
 
 		 379 aa  293  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  46.79 
 
 		 372 aa  291  9e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  48.3 
 
 		 372 aa  290  4e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  46.42 
 
 		 377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  44.29 
 
 		 368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  42.62 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  42.94 
 
 		 358 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  42.62 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  44.21 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  42.82 
 
 		 371 aa  276  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  41.1 
 
 		 371 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  42.01 
 
 		 382 aa  269  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  42.66 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  39.14 
 
 		 367 aa  256  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  37.77 
 
 		 377 aa  255  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  40.6 
 
 		 366 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  40.32 
 
 		 372 aa  253  5.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  40.37 
 
 		 367 aa  253  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  40.27 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  40.11 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  39.1 
 
 		 375 aa  249  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  39.1 
 
 		 375 aa  249  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  39.1 
 
 		 375 aa  249  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  39.1 
 
 		 375 aa  249  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  40.49 
 
 		 360 aa  249  9e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  37.5 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  40.05 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  40.38 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  40.05 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  39.89 
 
 		 374 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  39.1 
 
 		 375 aa  247  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  41.02 
 
 		 365 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  41.03 
 
 		 360 aa  247  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  39.47 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  40.21 
 
 		 369 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  39.2 
 
 		 374 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  39.2 
 
 		 366 aa  245  8e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  39.1 
 
 		 375 aa  245  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  39.1 
 
 		 375 aa  245  9e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  39.2 
 
 		 374 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  39.3 
 
 		 368 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  40.05 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  41.13 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  41.13 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  41.13 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  38.83 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  39.1 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  36.71 
 
 		 372 aa  243  5e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  39.89 
 
 		 368 aa  242  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  38.17 
 
 		 367 aa  242  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  38.54 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  39.55 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  35.2 
 
 		 373 aa  240  4e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  39.73 
 
 		 374 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  40.54 
 
 		 383 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  37.43 
 
 		 375 aa  239  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  37.43 
 
 		 375 aa  239  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  37.43 
 
 		 375 aa  239  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  38.42 
 
 		 374 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  40.27 
 
 		 365 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  40.11 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  40.5 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  37.2 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  37.66 
 
 		 383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  39.02 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  39.78 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  37.04 
 
 		 367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  41.21 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  38.71 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  39.2 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>