234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0474 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  100 
 
 
395 aa  804    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  58.25 
 
 
410 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  59.22 
 
 
397 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  57.11 
 
 
393 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  54.76 
 
 
394 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  57.11 
 
 
393 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  56.48 
 
 
393 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  58.03 
 
 
416 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  57.58 
 
 
404 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  54.81 
 
 
395 aa  398  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  54.05 
 
 
390 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  56.56 
 
 
397 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  55.95 
 
 
404 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  55.7 
 
 
404 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  52.41 
 
 
394 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  54.18 
 
 
394 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  53.26 
 
 
387 aa  388  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  52.99 
 
 
403 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  53.87 
 
 
409 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  54.08 
 
 
387 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  51.87 
 
 
387 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  54.26 
 
 
392 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  50.8 
 
 
387 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  50.55 
 
 
386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  51.38 
 
 
373 aa  353  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  49.6 
 
 
372 aa  322  7e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  47.86 
 
 
372 aa  319  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  44.36 
 
 
403 aa  318  9e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  49.08 
 
 
377 aa  316  5e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  47.8 
 
 
358 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  52.81 
 
 
381 aa  310  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  46.01 
 
 
354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  45.73 
 
 
358 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  45.08 
 
 
404 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  46.68 
 
 
379 aa  296  4e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  45.45 
 
 
368 aa  292  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  44.35 
 
 
358 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  44.35 
 
 
358 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  44.62 
 
 
360 aa  280  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  45.14 
 
 
389 aa  279  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  41.91 
 
 
382 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  43.51 
 
 
367 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  43.51 
 
 
367 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  41.67 
 
 
360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  45.43 
 
 
371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  45.45 
 
 
371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  44.17 
 
 
371 aa  273  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  42.7 
 
 
365 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  43.32 
 
 
366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  43.05 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  42.78 
 
 
365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  41.26 
 
 
366 aa  268  8.999999999999999e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  41.78 
 
 
367 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  40.86 
 
 
368 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  39.95 
 
 
368 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  39.48 
 
 
391 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  43.51 
 
 
367 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  42.51 
 
 
366 aa  268  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  41.44 
 
 
386 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  40.32 
 
 
365 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  41.01 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  41.02 
 
 
364 aa  266  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  40.37 
 
 
370 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  43.05 
 
 
365 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  39.08 
 
 
371 aa  265  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  41.44 
 
 
388 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  40.37 
 
 
370 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  40.37 
 
 
370 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  41.99 
 
 
383 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  41.18 
 
 
386 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  40.37 
 
 
370 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  41.8 
 
 
365 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  41.53 
 
 
361 aa  264  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  40.64 
 
 
377 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  43.35 
 
 
367 aa  263  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  41.99 
 
 
365 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  41.99 
 
 
365 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  41.99 
 
 
365 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  40.05 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  39.47 
 
 
370 aa  262  6e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  41.99 
 
 
366 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  41.99 
 
 
366 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  41.99 
 
 
366 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  41.99 
 
 
366 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  41.99 
 
 
365 aa  262  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  41.29 
 
 
368 aa  262  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  41.99 
 
 
365 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  40.21 
 
 
364 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  41.99 
 
 
365 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  43.31 
 
 
372 aa  262  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  41.73 
 
 
365 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  41.47 
 
 
365 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  39.68 
 
 
367 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  41.99 
 
 
366 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  41.99 
 
 
366 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  42.63 
 
 
365 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  42.52 
 
 
365 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  40 
 
 
364 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  40 
 
 
364 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  40 
 
 
364 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>