234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3686 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  100 
 
 		 386 aa  796    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  93.54 
 
 		 387 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  69.21 
 
 		 387 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  61.38 
 
 		 409 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  59.78 
 
 		 387 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  59.89 
 
 		 387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  59.24 
 
 		 403 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  54.22 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  56.08 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  55.82 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  55.82 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  53.97 
 
 		 410 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  50.4 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  52.91 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  50.4 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  51.32 
 
 		 397 aa  364  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  49.74 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  51.06 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  49.33 
 
 		 393 aa  358  9e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  49.07 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  46.53 
 
 		 403 aa  351  2e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  50.55 
 
 		 395 aa  342  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  47.23 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  47.06 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  47.33 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  46.68 
 
 		 373 aa  325  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  45.93 
 
 		 381 aa  315  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  49.69 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  43.55 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  41.16 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  41.78 
 
 		 372 aa  275  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  41.19 
 
 		 382 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  42.59 
 
 		 379 aa  272  6e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  42.54 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  42.5 
 
 		 389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  42.15 
 
 		 377 aa  266  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  42.82 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  41.64 
 
 		 358 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  41.36 
 
 		 358 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  42.78 
 
 		 371 aa  260  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  41.57 
 
 		 354 aa  259  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  39.72 
 
 		 377 aa  249  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  40.95 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  41.87 
 
 		 360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  39.3 
 
 		 375 aa  243  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  39.57 
 
 		 365 aa  243  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  39.3 
 
 		 375 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  39.3 
 
 		 375 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  41.62 
 
 		 368 aa  242  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  39.28 
 
 		 368 aa  242  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2542  predicted protein  42.81 
 
 		 417 aa  242  9e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  40.67 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  39.44 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  41.92 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  40.35 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  40.67 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  39.39 
 
 		 365 aa  239  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  38.4 
 
 		 366 aa  239  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  42.86 
 
 		 391 aa  239  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  38.89 
 
 		 370 aa  238  9e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  39.32 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  40.44 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  40.44 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  38.66 
 
 		 368 aa  236  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  40.11 
 
 		 364 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  35.94 
 
 		 376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  40.5 
 
 		 364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  38.38 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  39.18 
 
 		 374 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  36.36 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  36.81 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  37.7 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  37.6 
 
 		 374 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  38.63 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  37.43 
 
 		 374 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  38.1 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  37.87 
 
 		 374 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  36.81 
 
 		 361 aa  232  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  38.44 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  37.33 
 
 		 374 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  39.11 
 
 		 364 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  39.3 
 
 		 373 aa  230  4e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  37.88 
 
 		 370 aa  229  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  39.23 
 
 		 364 aa  229  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  36.87 
 
 		 375 aa  229  9e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  38.71 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  38.67 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  38.98 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  36.78 
 
 		 374 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  38.02 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  36.6 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  41.04 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  38.02 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  41.59 
 
 		 372 aa  227  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  38.02 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  38.02 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  36.6 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  38.28 
 
 		 375 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  37.95 
 
 		 371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  36.97 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>