234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2117 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  100 
 
 		 404 aa  810    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  53.39 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  45.31 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  44.79 
 
 		 403 aa  317  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  46.89 
 
 		 373 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  45.92 
 
 		 395 aa  316  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  44.92 
 
 		 393 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  45.71 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  45.87 
 
 		 368 aa  306  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  45.6 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  45.29 
 
 		 381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  45.45 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  43.83 
 
 		 387 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  46.6 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  44.74 
 
 		 392 aa  300  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  42.82 
 
 		 409 aa  299  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  43.58 
 
 		 394 aa  298  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  43.01 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  43.64 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  43.44 
 
 		 382 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  43.64 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  43.52 
 
 		 393 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  41.15 
 
 		 387 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  41.42 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  43.85 
 
 		 358 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  45.98 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  45.6 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  45.52 
 
 		 379 aa  286  5e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  43.58 
 
 		 358 aa  285  8e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  48.68 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  43.35 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  48.42 
 
 		 372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  42.59 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  45.45 
 
 		 410 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  45.34 
 
 		 377 aa  276  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  45.45 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  41.44 
 
 		 354 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  45.97 
 
 		 404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  45.97 
 
 		 404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  41.58 
 
 		 372 aa  265  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07029  mitochondrial ATPase (Afg1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04130)  40.56 
 
 		 653 aa  251  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2542  predicted protein  38.19 
 
 		 417 aa  249  9e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  37.4 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  43.59 
 
 		 366 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  43.59 
 
 		 366 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  43.59 
 
 		 366 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  43.59 
 
 		 366 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  36.94 
 
 		 367 aa  239  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  43.04 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  43.59 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  38.85 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  43.59 
 
 		 365 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  37.76 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  43.27 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  38.75 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  38.5 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  37.86 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  43.27 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  43.59 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  37.2 
 
 		 367 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  43.59 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  43.59 
 
 		 365 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  43.59 
 
 		 365 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  43.27 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  42.39 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  36.01 
 
 		 372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  42.07 
 
 		 365 aa  236  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  38.1 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  42.95 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  37.6 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  42.86 
 
 		 365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  38.34 
 
 		 368 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  36.7 
 
 		 365 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  36.72 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  37.01 
 
 		 367 aa  232  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  37.57 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01350  hypothetical protein  36.96 
 
 		 521 aa  231  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  37.31 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  38.12 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  38.38 
 
 		 365 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  38.06 
 
 		 365 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  38.08 
 
 		 368 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  39.58 
 
 		 360 aa  229  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  39.12 
 
 		 369 aa  229  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  38.8 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  35.32 
 
 		 371 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  37.08 
 
 		 375 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  37.08 
 
 		 375 aa  226  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  37.08 
 
 		 375 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  37.02 
 
 		 376 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  35.32 
 
 		 367 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  41.56 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  36.87 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  38.38 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  36.15 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  35.55 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  37.04 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0392  AFG1 family ATPase  38.74 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  37.4 
 
 		 374 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  36.29 
 
 		 366 aa  222  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>