233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3975 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  93.54 
 
 		 386 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  100 
 
 		 387 aa  797    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  69.74 
 
 		 387 aa  551  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  61.64 
 
 		 409 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  60.05 
 
 		 387 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  59.51 
 
 		 403 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  60.16 
 
 		 387 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  54.5 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  56.88 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  56.61 
 
 		 404 aa  391  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  56.61 
 
 		 404 aa  391  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  54.76 
 
 		 410 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  53.44 
 
 		 416 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  51.06 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  52.38 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  52.11 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  49.87 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  49.74 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  49.06 
 
 		 393 aa  362  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  49.33 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  46.09 
 
 		 403 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  50.8 
 
 		 395 aa  353  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  47.4 
 
 		 395 aa  343  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  48.4 
 
 		 394 aa  336  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  47.33 
 
 		 394 aa  332  8e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  46.68 
 
 		 373 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  45.93 
 
 		 381 aa  318  7e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  48.77 
 
 		 372 aa  301  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  44.09 
 
 		 368 aa  295  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  40.62 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  42.56 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  43.89 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  42.89 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  42.78 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  40.81 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  42.67 
 
 		 377 aa  271  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  41.46 
 
 		 358 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  43.6 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  40.33 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  40.05 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  40.11 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  41 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  40.74 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  38.08 
 
 		 366 aa  246  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  36.72 
 
 		 376 aa  245  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2542  predicted protein  42.86 
 
 		 417 aa  244  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  41.62 
 
 		 339 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  38.17 
 
 		 372 aa  244  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  41.26 
 
 		 360 aa  243  5e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  38.77 
 
 		 375 aa  243  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  38.77 
 
 		 375 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  37.08 
 
 		 367 aa  242  6e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  38.77 
 
 		 375 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  38.38 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  39.55 
 
 		 364 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  39.06 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  38.24 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  39.89 
 
 		 368 aa  239  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  40.33 
 
 		 364 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  40.33 
 
 		 364 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  36.44 
 
 		 361 aa  239  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  39.78 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  39.28 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  39.28 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  39.28 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  38.44 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  37.9 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  36.73 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  36.73 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  38.05 
 
 		 371 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  40.95 
 
 		 391 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  36.1 
 
 		 368 aa  234  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  38.25 
 
 		 374 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  36.63 
 
 		 374 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  40.11 
 
 		 376 aa  234  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  36.78 
 
 		 374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  39.17 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  36.53 
 
 		 367 aa  232  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  37.4 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  39.28 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  39 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  36.46 
 
 		 374 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  38.1 
 
 		 368 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  41.27 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  37.83 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  35 
 
 		 374 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  39.42 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  37.88 
 
 		 368 aa  229  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  39.62 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  36.29 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  36.04 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  36.71 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  36.04 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  37.82 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  36.04 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  36.04 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  36.04 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  36.04 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  36.04 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  38.95 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>