234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4537 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  98.63 
 
 		 364 aa  753    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  84.07 
 
 		 364 aa  652    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 364 aa  759    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  90.11 
 
 		 364 aa  690    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  88.98 
 
 		 364 aa  685    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  90.38 
 
 		 364 aa  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  97.35 
 
 		 339 aa  691    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  81.32 
 
 		 364 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  98.35 
 
 		 364 aa  751    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  81.04 
 
 		 364 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  79.68 
 
 		 374 aa  619  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  65.67 
 
 		 377 aa  498  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  63.49 
 
 		 368 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  58.92 
 
 		 371 aa  468  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  60.81 
 
 		 365 aa  465  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  61.85 
 
 		 393 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  60.47 
 
 		 391 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  58.47 
 
 		 366 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  59.29 
 
 		 367 aa  450  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  59.35 
 
 		 368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  59.24 
 
 		 368 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  59.24 
 
 		 368 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  57.84 
 
 		 370 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  58.76 
 
 		 386 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  58.49 
 
 		 386 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  58.49 
 
 		 388 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  58.49 
 
 		 369 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  57.84 
 
 		 370 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  58.42 
 
 		 368 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  56.91 
 
 		 370 aa  431  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  57.84 
 
 		 370 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  57.84 
 
 		 370 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  56.6 
 
 		 370 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  57.84 
 
 		 370 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  57.84 
 
 		 370 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  56.52 
 
 		 367 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  56.13 
 
 		 367 aa  411  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  56.95 
 
 		 367 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  55.08 
 
 		 372 aa  401  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  52.07 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  50.94 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  50.94 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  50.53 
 
 		 376 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  50.94 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  51.75 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  51.48 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  51.75 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  51.75 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  51.74 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  51.75 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  51.75 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  51.74 
 
 		 374 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  51.48 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  51.48 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  51.48 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  51.47 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  49.32 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  51.61 
 
 		 374 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  51.21 
 
 		 374 aa  362  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  51.47 
 
 		 374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  49.6 
 
 		 376 aa  362  6e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  50.14 
 
 		 383 aa  360  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  51.25 
 
 		 360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  49.73 
 
 		 376 aa  355  5.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  48.62 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  48.78 
 
 		 383 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  48.6 
 
 		 365 aa  349  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  48.6 
 
 		 365 aa  348  7e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  48.88 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  48.6 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  48.6 
 
 		 366 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  47.66 
 
 		 373 aa  346  3e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  48.04 
 
 		 365 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  48.6 
 
 		 365 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  48.6 
 
 		 366 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  48.6 
 
 		 366 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  48.6 
 
 		 366 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  48.32 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  48.32 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  48.33 
 
 		 365 aa  345  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  48.32 
 
 		 366 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  47.35 
 
 		 371 aa  343  4e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  47.38 
 
 		 373 aa  343  4e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  48.32 
 
 		 365 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  48.32 
 
 		 365 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  48.04 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  47.49 
 
 		 365 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  47.49 
 
 		 383 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  50.14 
 
 		 365 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  46.65 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  47.21 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  45.83 
 
 		 365 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  49.86 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  49.86 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  46.09 
 
 		 365 aa  332  6e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  48.32 
 
 		 367 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  48.47 
 
 		 365 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  49.31 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  48.03 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  49.29 
 
 		 366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>