233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3602 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  100 
 
 
390 aa  791    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  61.13 
 
 
395 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  60.26 
 
 
397 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  59.22 
 
 
416 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  58.18 
 
 
410 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  56.74 
 
 
404 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  56.4 
 
 
393 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  56.59 
 
 
393 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  55.96 
 
 
404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  54.69 
 
 
393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  55.96 
 
 
404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  54.03 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  53.76 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  52.69 
 
 
394 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  56.59 
 
 
397 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  53.24 
 
 
387 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  54.05 
 
 
395 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  53.04 
 
 
387 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  49.87 
 
 
387 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  53.28 
 
 
373 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  51.55 
 
 
394 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  50.4 
 
 
386 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  52.86 
 
 
394 aa  361  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  51.09 
 
 
409 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  51.06 
 
 
392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  49.33 
 
 
381 aa  338  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  43.26 
 
 
403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  45.92 
 
 
372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  48.29 
 
 
377 aa  306  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  47.89 
 
 
379 aa  306  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  45.19 
 
 
404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  46.43 
 
 
358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  46.15 
 
 
368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  46.47 
 
 
358 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  44.91 
 
 
382 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  46.79 
 
 
372 aa  300  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  46.47 
 
 
358 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  46.49 
 
 
358 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  48.27 
 
 
371 aa  298  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  46.43 
 
 
389 aa  292  6e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  43.56 
 
 
354 aa  282  8.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  40.75 
 
 
377 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  42.86 
 
 
371 aa  277  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  43.16 
 
 
371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  42.62 
 
 
360 aa  266  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  41.08 
 
 
367 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  42.02 
 
 
372 aa  263  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  41.14 
 
 
360 aa  262  8e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  40.64 
 
 
375 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  40.64 
 
 
366 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  40.7 
 
 
361 aa  260  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  40.64 
 
 
375 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  40.64 
 
 
375 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  40.27 
 
 
367 aa  257  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  39.35 
 
 
366 aa  257  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  40.27 
 
 
367 aa  257  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  37.8 
 
 
372 aa  255  8e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  40.74 
 
 
393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  38.34 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  40 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  40.44 
 
 
366 aa  253  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  40 
 
 
365 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  39.05 
 
 
376 aa  252  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  41.34 
 
 
365 aa  252  7e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  41.14 
 
 
367 aa  252  8.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  40.79 
 
 
367 aa  252  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  40.27 
 
 
365 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  40.43 
 
 
365 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  38.4 
 
 
367 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  39.63 
 
 
374 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  37.34 
 
 
373 aa  250  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  40.38 
 
 
365 aa  250  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  38.83 
 
 
364 aa  250  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  41.29 
 
 
365 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  39.47 
 
 
376 aa  249  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  36.95 
 
 
391 aa  249  6e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  38.3 
 
 
383 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  36.87 
 
 
373 aa  249  7e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  39.95 
 
 
367 aa  249  7e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  40.44 
 
 
365 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  40.44 
 
 
365 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  39.36 
 
 
374 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  38.16 
 
 
371 aa  248  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  40.17 
 
 
365 aa  248  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  39.36 
 
 
374 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  39.36 
 
 
374 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  38.24 
 
 
374 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  40.11 
 
 
368 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  39.73 
 
 
365 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  40.17 
 
 
365 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  39.89 
 
 
383 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  40.17 
 
 
365 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  39.19 
 
 
367 aa  247  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  40 
 
 
371 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  38.11 
 
 
365 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  39.35 
 
 
365 aa  246  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  38.38 
 
 
370 aa  246  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  39.62 
 
 
366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  39.35 
 
 
366 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  37.5 
 
 
368 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>