235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0112 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  100 
 
 		 389 aa  796    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  63.97 
 
 		 354 aa  461  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  61.19 
 
 		 358 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  60.82 
 
 		 368 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  61.39 
 
 		 358 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  61.39 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  62.22 
 
 		 358 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  50.28 
 
 		 373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  47.85 
 
 		 381 aa  308  9e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  48.53 
 
 		 397 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  47.14 
 
 		 395 aa  299  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  48.53 
 
 		 416 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  49.32 
 
 		 379 aa  297  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  47.66 
 
 		 372 aa  293  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  46.43 
 
 		 390 aa  292  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  47.14 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  45.82 
 
 		 393 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  44.38 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  47.8 
 
 		 410 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  41.5 
 
 		 403 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  44.99 
 
 		 377 aa  286  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  45.15 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  46.09 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  48.68 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  42.7 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  46.15 
 
 		 372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  44.9 
 
 		 404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  45.88 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  43.94 
 
 		 393 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  46.2 
 
 		 387 aa  278  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  44.01 
 
 		 409 aa  278  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  44.41 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  43.89 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  44.21 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  45.55 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  45.14 
 
 		 395 aa  272  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  46.94 
 
 		 371 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  44.72 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  42.5 
 
 		 386 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  43.82 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  39.84 
 
 		 403 aa  259  7e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  42.35 
 
 		 366 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  42.35 
 
 		 366 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  42.35 
 
 		 366 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  42.35 
 
 		 366 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  40.5 
 
 		 366 aa  255  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  42.06 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  41.31 
 
 		 371 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  42.06 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  42.06 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  42.06 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  42.27 
 
 		 365 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  41.85 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  42.06 
 
 		 365 aa  250  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  41.4 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  41.69 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  42.21 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  41.4 
 
 		 365 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  40.46 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  41.11 
 
 		 367 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  40.82 
 
 		 367 aa  246  6e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  41.6 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  42.7 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  41.11 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  41.11 
 
 		 365 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  41.11 
 
 		 365 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  40.06 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  40.88 
 
 		 365 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  39.89 
 
 		 365 aa  242  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  40.8 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  40.88 
 
 		 365 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  38.66 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  39.6 
 
 		 367 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  39.6 
 
 		 367 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  37.88 
 
 		 365 aa  239  8e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0392  AFG1 family ATPase  36.36 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  38.94 
 
 		 365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0624  AFG1-like ATPase  35.93 
 
 		 351 aa  236  6e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.208212  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  38.94 
 
 		 365 aa  236  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  36.77 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  41.36 
 
 		 361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  40 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  39.56 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3538  predicted protein  43.44 
 
 		 319 aa  233  5e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.366937  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  40.86 
 
 		 365 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  37.94 
 
 		 365 aa  232  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  37.05 
 
 		 367 aa  230  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  38.53 
 
 		 365 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  40.06 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  40.17 
 
 		 369 aa  229  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  40.22 
 
 		 370 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  39.78 
 
 		 370 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  40.78 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  39.78 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  38.27 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  40.78 
 
 		 370 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  38.42 
 
 		 367 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  38.12 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  39.5 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  38.38 
 
 		 370 aa  226  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>