235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0870 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  92.82 
 
 		 404 aa  719    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  100 
 
 		 404 aa  810    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  93.32 
 
 		 404 aa  720    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  80.1 
 
 		 410 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  72.38 
 
 		 416 aa  541  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  70.59 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  58.67 
 
 		 387 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  58.4 
 
 		 403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  56.95 
 
 		 387 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  56.74 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  58.16 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  57.62 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  58.82 
 
 		 393 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  59.13 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  55.87 
 
 		 394 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  59.3 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  57.14 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  56.88 
 
 		 387 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  57.58 
 
 		 395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  58.12 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  58.24 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  56.08 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  56.49 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  55.56 
 
 		 409 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  56.95 
 
 		 373 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  47.66 
 
 		 403 aa  353  2e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  49.74 
 
 		 381 aa  339  5.9999999999999996e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  48.64 
 
 		 368 aa  322  9.000000000000001e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  50 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  50 
 
 		 379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  47.49 
 
 		 372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  46.15 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  47.14 
 
 		 377 aa  302  7.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  46.41 
 
 		 358 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  46.41 
 
 		 358 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  47.14 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  47.22 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  47.01 
 
 		 354 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  46.7 
 
 		 358 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  43.83 
 
 		 377 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  45.19 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  43.78 
 
 		 371 aa  286  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  41.67 
 
 		 367 aa  282  7.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  43.05 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  43.94 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  47.45 
 
 		 371 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  43.94 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  46.77 
 
 		 360 aa  280  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  43.67 
 
 		 364 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  43.94 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  44.2 
 
 		 364 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  40.59 
 
 		 367 aa  276  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  41.24 
 
 		 367 aa  275  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  39.19 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  43.78 
 
 		 360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  41.18 
 
 		 370 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  44.18 
 
 		 374 aa  275  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  44.67 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  42.78 
 
 		 370 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  42.78 
 
 		 370 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  42.78 
 
 		 370 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  42.78 
 
 		 386 aa  273  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  38.87 
 
 		 368 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  42.78 
 
 		 370 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  43.55 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  42.51 
 
 		 370 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  40.11 
 
 		 368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  43.28 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  42.51 
 
 		 388 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  42.86 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  42.86 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  42.25 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  42.51 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  40.86 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  46.33 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  38.93 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  38.93 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  38.93 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  41.98 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  41.91 
 
 		 369 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  39.84 
 
 		 366 aa  263  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  39.95 
 
 		 368 aa  262  8e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  38.62 
 
 		 368 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  40.54 
 
 		 365 aa  262  8.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  42.12 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  41.22 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  41.11 
 
 		 370 aa  259  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  41.73 
 
 		 366 aa  260  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  41.9 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  40.63 
 
 		 374 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  40.63 
 
 		 374 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  40.37 
 
 		 374 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  36.91 
 
 		 373 aa  258  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  36.19 
 
 		 392 aa  258  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  40.92 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  38.92 
 
 		 367 aa  258  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  41.23 
 
 		 371 aa  257  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  40.37 
 
 		 374 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  36.15 
 
 		 373 aa  256  4e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  40.97 
 
 		 365 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>