234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0056 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  100 
 
 
358 aa  729    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  61.06 
 
 
354 aa  433  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  61.19 
 
 
389 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  61.8 
 
 
358 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  61.8 
 
 
358 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  61.69 
 
 
358 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  58.61 
 
 
368 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  51.1 
 
 
379 aa  326  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  50.28 
 
 
372 aa  324  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  50.41 
 
 
397 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  47.68 
 
 
395 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  50.28 
 
 
373 aa  316  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  49.86 
 
 
372 aa  315  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  47.57 
 
 
381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  46.43 
 
 
390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  47.8 
 
 
395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  49.86 
 
 
416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  44.72 
 
 
387 aa  302  7.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  44.17 
 
 
403 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  44.66 
 
 
409 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  48.5 
 
 
371 aa  296  5e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  46.56 
 
 
393 aa  295  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  47.41 
 
 
394 aa  291  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  49.27 
 
 
392 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  47.14 
 
 
394 aa  291  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  44.66 
 
 
387 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  43.32 
 
 
404 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  43.13 
 
 
387 aa  286  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  47.22 
 
 
404 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  47.35 
 
 
410 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  45.55 
 
 
377 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  44.78 
 
 
393 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  45.75 
 
 
397 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  44.35 
 
 
393 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  45.6 
 
 
394 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  42.78 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  51.97 
 
 
404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  51.49 
 
 
404 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  42.54 
 
 
386 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  44.1 
 
 
366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  44.1 
 
 
365 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  44.1 
 
 
366 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  43.82 
 
 
366 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  43.73 
 
 
382 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  43.82 
 
 
366 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  40.57 
 
 
403 aa  268  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  43.82 
 
 
366 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  43.82 
 
 
366 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  43.26 
 
 
365 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  43.06 
 
 
383 aa  262  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  43.06 
 
 
365 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  43.06 
 
 
365 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  42.78 
 
 
365 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  42.78 
 
 
365 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  42.49 
 
 
365 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  42.78 
 
 
365 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  40.85 
 
 
371 aa  255  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  39.61 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  40.06 
 
 
365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  41.93 
 
 
365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  41.23 
 
 
365 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  40.79 
 
 
365 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  40.64 
 
 
365 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  40.5 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  38.69 
 
 
374 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  38.69 
 
 
374 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  39.64 
 
 
367 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  38.69 
 
 
374 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  41.37 
 
 
365 aa  242  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  43.28 
 
 
371 aa  242  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  39.83 
 
 
365 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  39.77 
 
 
365 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  39.04 
 
 
360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  39.05 
 
 
367 aa  239  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  40.11 
 
 
361 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  38.42 
 
 
374 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  41.97 
 
 
367 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  37.6 
 
 
375 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  41.18 
 
 
360 aa  238  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  38.69 
 
 
374 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  37.81 
 
 
374 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  37.33 
 
 
375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  37.33 
 
 
375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  37.06 
 
 
375 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  39.44 
 
 
366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  42.95 
 
 
365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  37.06 
 
 
375 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  37.06 
 
 
375 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  37.06 
 
 
375 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  37.06 
 
 
375 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  37.06 
 
 
375 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07029  mitochondrial ATPase (Afg1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04130)  39.72 
 
 
653 aa  230  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  38.29 
 
 
366 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0392  AFG1 family ATPase  39.87 
 
 
351 aa  229  5e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  38.98 
 
 
365 aa  226  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0624  AFG1-like ATPase  36.65 
 
 
351 aa  225  8e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.208212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  36.81 
 
 
368 aa  225  9e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  37.38 
 
 
371 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  35.97 
 
 
368 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  38.22 
 
 
365 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>