234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0282 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  100 
 
 		 393 aa  805    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  92.88 
 
 		 393 aa  750    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  82.49 
 
 		 394 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  73.47 
 
 		 393 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  78.79 
 
 		 397 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  71.68 
 
 		 394 aa  556  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  72.75 
 
 		 394 aa  545  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  59.03 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  59.8 
 
 		 416 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  58.82 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  56.59 
 
 		 390 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  57.95 
 
 		 410 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  57.11 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  58.27 
 
 		 404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  58.02 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  52.93 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  54.13 
 
 		 387 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  54.01 
 
 		 387 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  53.49 
 
 		 409 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  53.48 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  54.2 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  50.13 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  53.44 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  50.13 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  53.3 
 
 		 373 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  46.32 
 
 		 403 aa  328  8e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  47.64 
 
 		 381 aa  325  1e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  49.87 
 
 		 371 aa  312  7.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  48.94 
 
 		 372 aa  305  8.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  48.8 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  44.38 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  44.04 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  44.9 
 
 		 358 aa  286  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  44.74 
 
 		 389 aa  286  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  46.07 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  42.67 
 
 		 382 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  45.89 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  42.11 
 
 		 358 aa  275  8e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  41.83 
 
 		 358 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  42.08 
 
 		 371 aa  270  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  41.83 
 
 		 358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  42.9 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  42.66 
 
 		 354 aa  266  5.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  41.14 
 
 		 371 aa  265  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  41.73 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  41.38 
 
 		 365 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  40.58 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  38.86 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  39.78 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  39.05 
 
 		 367 aa  255  8e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  40.32 
 
 		 370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  40.11 
 
 		 370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  40.22 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  40.11 
 
 		 370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  39.42 
 
 		 374 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  38.38 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  39.58 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  40.27 
 
 		 364 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  39.58 
 
 		 388 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  39.52 
 
 		 370 aa  249  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  39.35 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  39.52 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  39.09 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  39.68 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  40.16 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  39.52 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  38.54 
 
 		 365 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  39.31 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  40 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  39.53 
 
 		 365 aa  247  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  39.31 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  39.05 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  38.01 
 
 		 367 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  39.31 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  41.18 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  40.05 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  39.47 
 
 		 371 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  38.56 
 
 		 376 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  41.13 
 
 		 367 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  39.05 
 
 		 370 aa  246  6e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  38.89 
 
 		 383 aa  245  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  38.21 
 
 		 368 aa  245  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  39.31 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  39.41 
 
 		 374 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  39.52 
 
 		 367 aa  245  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  37.93 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  39.46 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  39.26 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  39.26 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  37.6 
 
 		 375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  37.6 
 
 		 375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  36.86 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  37.6 
 
 		 375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  38.99 
 
 		 365 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  38.99 
 
 		 365 aa  242  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  37.84 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  39.67 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  39.31 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  37.6 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  37.6 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>