234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2673 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  100 
 
 		 354 aa  722    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  63.97 
 
 		 389 aa  461  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  64.41 
 
 		 358 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  63.28 
 
 		 358 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  62.54 
 
 		 358 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  61.06 
 
 		 358 aa  433  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  58.56 
 
 		 368 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  50.14 
 
 		 373 aa  322  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  47.77 
 
 		 381 aa  311  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  44.88 
 
 		 395 aa  300  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  46.01 
 
 		 395 aa  299  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  47.5 
 
 		 372 aa  296  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  45.51 
 
 		 372 aa  294  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  49.3 
 
 		 379 aa  294  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  47.24 
 
 		 416 aa  292  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  43.65 
 
 		 387 aa  289  6e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  47.01 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  46.13 
 
 		 397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  43.53 
 
 		 409 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  43.09 
 
 		 403 aa  285  8e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  43.56 
 
 		 390 aa  282  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  46.03 
 
 		 410 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  46.51 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  46.59 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  46.59 
 
 		 404 aa  276  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  42.54 
 
 		 387 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  41.44 
 
 		 404 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  42.08 
 
 		 387 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  43.92 
 
 		 392 aa  268  8.999999999999999e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  42.35 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  45.71 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  42.66 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  44.08 
 
 		 377 aa  263  4.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  42.66 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  41.44 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  42.11 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  41.57 
 
 		 386 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  41 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  41.44 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  43.33 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  37.14 
 
 		 403 aa  246  3e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  41.38 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  37.92 
 
 		 360 aa  236  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  39.66 
 
 		 371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  38.92 
 
 		 366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  40.86 
 
 		 361 aa  233  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  40.8 
 
 		 367 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  40.34 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  40.11 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  38.64 
 
 		 365 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  37.75 
 
 		 367 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  40.69 
 
 		 366 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  38.64 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  38.64 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  38.35 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  38.64 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  38.64 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  38.59 
 
 		 369 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  37.91 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  39.66 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  39.2 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  38.92 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  37.5 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  38.92 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  38.92 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  36.21 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  38.35 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  39.66 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  39.66 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  39.38 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  38.35 
 
 		 366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  38.35 
 
 		 365 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  35.93 
 
 		 365 aa  225  7e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  38.74 
 
 		 376 aa  225  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  38.92 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  38.64 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  36.91 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  36.93 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  39.08 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  38.07 
 
 		 383 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  37.85 
 
 		 375 aa  222  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  37.85 
 
 		 375 aa  222  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  37.85 
 
 		 375 aa  222  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  38.64 
 
 		 365 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  35.81 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  38.81 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  36.08 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  36.41 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  36.44 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  36.91 
 
 		 368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  36.08 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  39.66 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  36.81 
 
 		 376 aa  219  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  40.73 
 
 		 365 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  36.54 
 
 		 375 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  36.54 
 
 		 375 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  36.36 
 
 		 374 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  36.09 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  36.36 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  36.09 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>