232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2500 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  100 
 
 		 395 aa  806    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  61.13 
 
 		 390 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  59.17 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  60 
 
 		 416 aa  421  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  57.55 
 
 		 410 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  57.14 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  52.93 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  55.61 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  53.39 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  57.25 
 
 		 404 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  52.93 
 
 		 393 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  54.81 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  57.25 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  51.64 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  49.2 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  48.93 
 
 		 403 aa  363  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  53.68 
 
 		 373 aa  360  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  51.03 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  49.48 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  48.26 
 
 		 387 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  51.54 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  50 
 
 		 409 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  47.4 
 
 		 387 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  47.23 
 
 		 386 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  48.01 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  47.68 
 
 		 358 aa  319  5e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  47.04 
 
 		 368 aa  318  9e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  46.05 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  45.41 
 
 		 404 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  48.64 
 
 		 392 aa  311  9e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  48.7 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  46.45 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  45.92 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  45.9 
 
 		 358 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  48.57 
 
 		 377 aa  302  5.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  44.88 
 
 		 354 aa  300  4e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  47.14 
 
 		 389 aa  299  5e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  43.42 
 
 		 403 aa  295  9e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  47.34 
 
 		 371 aa  293  5e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  43.73 
 
 		 382 aa  289  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  46.3 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  41.44 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  42.86 
 
 		 371 aa  269  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  40.21 
 
 		 367 aa  269  8e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  40.59 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  40.87 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  39.74 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  39.47 
 
 		 374 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  39.47 
 
 		 374 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  39.21 
 
 		 374 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  39.78 
 
 		 364 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  39.9 
 
 		 393 aa  262  8.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  40.32 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  39.62 
 
 		 367 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  40.05 
 
 		 364 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  38.95 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  38.4 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  39.31 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  40.05 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  39.31 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  39.31 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  39.57 
 
 		 364 aa  259  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  43.47 
 
 		 372 aa  259  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  38.44 
 
 		 364 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  39.52 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  38.17 
 
 		 364 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  39.84 
 
 		 371 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  38.17 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  39.47 
 
 		 374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  42.14 
 
 		 370 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  41.14 
 
 		 361 aa  252  7e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  37.63 
 
 		 375 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  37.63 
 
 		 375 aa  252  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  37.63 
 
 		 375 aa  252  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  37.63 
 
 		 375 aa  252  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  37.63 
 
 		 375 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  37.96 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  38.21 
 
 		 368 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  39.52 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  39.25 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  37.11 
 
 		 375 aa  249  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  37.11 
 
 		 375 aa  249  7e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  37.27 
 
 		 375 aa  249  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  37.37 
 
 		 375 aa  249  9e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  38.81 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  41.78 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  38.11 
 
 		 370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  40.58 
 
 		 365 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  40.54 
 
 		 391 aa  245  8e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  37.77 
 
 		 368 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  37.11 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  39.46 
 
 		 386 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  37.34 
 
 		 376 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  40.58 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  36.94 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  38.64 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  39.56 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  39.19 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  39.4 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  38.38 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>