234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1121 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  90.18 
 
 		 397 aa  718    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  100 
 
 		 416 aa  828    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  72.89 
 
 		 410 aa  542  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  72.38 
 
 		 404 aa  528  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  71.94 
 
 		 404 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  71.68 
 
 		 404 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  59.22 
 
 		 390 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  60.05 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  60 
 
 		 395 aa  430  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  59.29 
 
 		 393 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  57.92 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  58.03 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  56.57 
 
 		 387 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  56.3 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  59.7 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  54.16 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  58.03 
 
 		 395 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  57.87 
 
 		 394 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  56.35 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  57.54 
 
 		 409 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  55.9 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  56.15 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  53.44 
 
 		 387 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  53.93 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  52.91 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  48.05 
 
 		 403 aa  354  2e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  56.23 
 
 		 381 aa  346  3e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  51.46 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  50.92 
 
 		 372 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  48.91 
 
 		 368 aa  320  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  49.86 
 
 		 358 aa  313  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  49.31 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  51.05 
 
 		 379 aa  309  5e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  49.31 
 
 		 358 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  48.44 
 
 		 377 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  49.86 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  47.73 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  48.53 
 
 		 389 aa  299  6e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  47.24 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  45.73 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  44.96 
 
 		 371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  40.43 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  46.3 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  42.32 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  48.26 
 
 		 371 aa  275  8e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  42.22 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  43.75 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  42.55 
 
 		 364 aa  272  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  41.22 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  46.11 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  42.55 
 
 		 364 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  41.76 
 
 		 364 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  41.89 
 
 		 364 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  42.36 
 
 		 367 aa  269  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  42.02 
 
 		 364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  41.51 
 
 		 391 aa  268  8.999999999999999e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  40.99 
 
 		 374 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  41.76 
 
 		 364 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  39.95 
 
 		 367 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  41.49 
 
 		 364 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  39.67 
 
 		 372 aa  265  8.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  41.78 
 
 		 339 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  40.92 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  39.36 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  42.7 
 
 		 370 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  41.27 
 
 		 370 aa  259  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  37.93 
 
 		 383 aa  259  9e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  42.16 
 
 		 388 aa  259  9e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  46.23 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  39.25 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  42.16 
 
 		 386 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  39.1 
 
 		 374 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  42.43 
 
 		 370 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  41.89 
 
 		 386 aa  257  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  39.1 
 
 		 374 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  38.83 
 
 		 374 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  38.38 
 
 		 376 aa  255  8e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  43.01 
 
 		 369 aa  255  9e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  40.83 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  42.2 
 
 		 370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  39.06 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  39.06 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  37.14 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  42.2 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  39.06 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  39.26 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  39.9 
 
 		 375 aa  253  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  39.9 
 
 		 375 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  39.63 
 
 		 375 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  36.87 
 
 		 373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  39.63 
 
 		 375 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  39.63 
 
 		 375 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  39.63 
 
 		 375 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  41.89 
 
 		 370 aa  253  7e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  39.63 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  37.63 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  41.76 
 
 		 393 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  39.36 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  40.05 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  39.41 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>