233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4130 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  793    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  69.74 
 
 		 387 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  69.21 
 
 		 386 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  64.15 
 
 		 409 aa  495  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  59.73 
 
 		 387 aa  464  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  60.05 
 
 		 387 aa  461  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  59.19 
 
 		 403 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  58.71 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  59.13 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  56.95 
 
 		 410 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  58.04 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  58.04 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  49.87 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  54.77 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  53.04 
 
 		 390 aa  378  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  53.93 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  55.9 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  54.08 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  54.2 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  55.41 
 
 		 397 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  51.63 
 
 		 394 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  49.48 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  52.1 
 
 		 393 aa  355  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  49.74 
 
 		 373 aa  345  5e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  51.46 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  48.27 
 
 		 381 aa  338  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  50.4 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  51.91 
 
 		 372 aa  312  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  43.83 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  47.54 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  45.31 
 
 		 368 aa  299  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  44.66 
 
 		 358 aa  290  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  46.13 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  40.37 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  46.2 
 
 		 389 aa  278  9e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  42.23 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  45.38 
 
 		 371 aa  276  4e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  41.42 
 
 		 358 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  41.42 
 
 		 358 aa  275  8e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  45.5 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  42.08 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  43.22 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  44.69 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  40.27 
 
 		 383 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  40.97 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  41.24 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  40.43 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  40.97 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  40.97 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  40.97 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  39.95 
 
 		 366 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  40.97 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  40.43 
 
 		 365 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  40.43 
 
 		 365 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  40.97 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  40.97 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  39.66 
 
 		 377 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  39.89 
 
 		 366 aa  256  6e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  39.89 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  39.89 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  39.2 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  39.62 
 
 		 365 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  40.91 
 
 		 371 aa  253  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  39.62 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  39.62 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  40.77 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  40.43 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  41.24 
 
 		 365 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  41.52 
 
 		 365 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  38.48 
 
 		 365 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  39.78 
 
 		 365 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  38.21 
 
 		 365 aa  246  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  40.06 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  39.24 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  39.89 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  38.32 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  39.77 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  42.04 
 
 		 372 aa  243  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  38.68 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  37.57 
 
 		 367 aa  239  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  38.81 
 
 		 367 aa  239  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  36.93 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  40 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  39.17 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  36.48 
 
 		 368 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  39.17 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  36.59 
 
 		 367 aa  237  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  38.94 
 
 		 370 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  36.59 
 
 		 367 aa  237  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  39.53 
 
 		 374 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  39.53 
 
 		 374 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  38.35 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  38.66 
 
 		 364 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  37.54 
 
 		 368 aa  236  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  37.94 
 
 		 365 aa  236  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3538  predicted protein  41.67 
 
 		 319 aa  236  7e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.366937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  37.5 
 
 		 372 aa  235  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  37.09 
 
 		 375 aa  235  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  37.09 
 
 		 375 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  37.09 
 
 		 375 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>