234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1272 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  751    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  85.21 
 
 		 365 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  92.6 
 
 		 365 aa  708    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  86.3 
 
 		 365 aa  668    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  93.42 
 
 		 365 aa  711    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  80 
 
 		 366 aa  620  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  80 
 
 		 365 aa  621  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  80 
 
 		 365 aa  621  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  80 
 
 		 366 aa  620  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  80 
 
 		 366 aa  620  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  80 
 
 		 366 aa  620  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  80 
 
 		 366 aa  620  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  80 
 
 		 365 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  79.73 
 
 		 366 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  78.63 
 
 		 365 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  78.36 
 
 		 365 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  78.36 
 
 		 365 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  78.36 
 
 		 365 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  78.36 
 
 		 365 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  77.53 
 
 		 383 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  77.53 
 
 		 365 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  77.26 
 
 		 365 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  77.26 
 
 		 365 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  67.95 
 
 		 365 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  68.12 
 
 		 367 aa  528  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  69.23 
 
 		 366 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  68.41 
 
 		 366 aa  527  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  68.32 
 
 		 367 aa  525  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  68.12 
 
 		 367 aa  525  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  66.58 
 
 		 365 aa  520  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  67.12 
 
 		 365 aa  518  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  65.29 
 
 		 367 aa  508  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  65.21 
 
 		 367 aa  503  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  65.21 
 
 		 367 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  64.11 
 
 		 371 aa  495  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  65.21 
 
 		 367 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  58.07 
 
 		 371 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  56.46 
 
 		 371 aa  398  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  49.44 
 
 		 377 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  48.49 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  47.27 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  47.49 
 
 		 364 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  46.85 
 
 		 364 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  46.65 
 
 		 374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  46.4 
 
 		 391 aa  335  5e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  46.09 
 
 		 364 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  46.09 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  47.4 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  46.09 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  47.4 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  47.4 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  48.6 
 
 		 360 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  47.13 
 
 		 339 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  46.65 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  44.72 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  45.35 
 
 		 368 aa  316  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  46.37 
 
 		 386 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  44.89 
 
 		 367 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  44.94 
 
 		 370 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  46.09 
 
 		 388 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  46.91 
 
 		 368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  46.61 
 
 		 372 aa  312  4.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  45.81 
 
 		 370 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  45.81 
 
 		 370 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  45.81 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  45.81 
 
 		 370 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  43.49 
 
 		 371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  43.73 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  45.03 
 
 		 367 aa  310  4e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  44.76 
 
 		 368 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  46.07 
 
 		 370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  44.97 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  44.63 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  44.82 
 
 		 370 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  44.32 
 
 		 367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  46.01 
 
 		 374 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  44.04 
 
 		 367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  45.79 
 
 		 369 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  46.39 
 
 		 375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  46.11 
 
 		 375 aa  301  9e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  46.11 
 
 		 375 aa  301  9e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  46.11 
 
 		 375 aa  301  9e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  46.11 
 
 		 375 aa  301  9e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  45.28 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  45.73 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  46.11 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  45.38 
 
 		 360 aa  300  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  44.9 
 
 		 375 aa  299  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  45.45 
 
 		 374 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  44.9 
 
 		 375 aa  299  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  44.9 
 
 		 375 aa  299  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  45.83 
 
 		 375 aa  298  9e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  45.83 
 
 		 375 aa  298  9e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  45.83 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  45.45 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  43.19 
 
 		 372 aa  292  7e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  44.9 
 
 		 374 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  42.78 
 
 		 383 aa  291  9e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  42.86 
 
 		 376 aa  288  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  40.06 
 
 		 392 aa  286  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>