238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0546 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  85.79 
 
 		 394 aa  678    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  100 
 
 		 394 aa  807    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  74.62 
 
 		 393 aa  606  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  73.91 
 
 		 393 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  71.13 
 
 		 393 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  68.88 
 
 		 394 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  71.79 
 
 		 397 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  58.12 
 
 		 404 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  58.85 
 
 		 397 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  59.11 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  54.18 
 
 		 395 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  58.27 
 
 		 410 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  59.17 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  58.91 
 
 		 404 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  52.86 
 
 		 390 aa  388  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  53.26 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  51.54 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  52.72 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  50.13 
 
 		 387 aa  364  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  51.52 
 
 		 409 aa  354  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  50.4 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  51.37 
 
 		 392 aa  348  8e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  48.4 
 
 		 387 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  52.34 
 
 		 373 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  47.33 
 
 		 386 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  45.55 
 
 		 403 aa  322  9.999999999999999e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  46.07 
 
 		 381 aa  312  6.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  47.14 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  43.58 
 
 		 404 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  48.27 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  47.59 
 
 		 372 aa  292  9e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  47.45 
 
 		 371 aa  290  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  44.66 
 
 		 368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  45.45 
 
 		 377 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  45.45 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  42.19 
 
 		 358 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  41.92 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  41.67 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  42.97 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  41.44 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  40.33 
 
 		 371 aa  264  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  40.89 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  40.43 
 
 		 371 aa  260  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  41.6 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  40.49 
 
 		 366 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  41.05 
 
 		 365 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  40.77 
 
 		 365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  40 
 
 		 367 aa  245  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  39.45 
 
 		 367 aa  245  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2542  predicted protein  35.9 
 
 		 417 aa  243  3e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  39.78 
 
 		 361 aa  243  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  39.07 
 
 		 366 aa  242  7.999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  40.27 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  40.27 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  39.23 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  39.41 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  38.1 
 
 		 360 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  37.6 
 
 		 374 aa  239  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  39.23 
 
 		 374 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  38.72 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  40.22 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  38.34 
 
 		 374 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  39.94 
 
 		 365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  39.94 
 
 		 365 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  39.94 
 
 		 365 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  39.84 
 
 		 365 aa  236  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  39.19 
 
 		 383 aa  235  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  40.6 
 
 		 360 aa  235  9e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  38.4 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  37.2 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  38.34 
 
 		 374 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  39.94 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  39.94 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  37.5 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  38.5 
 
 		 365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  39.39 
 
 		 366 aa  233  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  38.38 
 
 		 367 aa  233  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  38.02 
 
 		 371 aa  233  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  38.97 
 
 		 374 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  37.18 
 
 		 375 aa  232  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  37.44 
 
 		 375 aa  232  9e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  39.08 
 
 		 367 aa  232  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  37.18 
 
 		 375 aa  232  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  37.18 
 
 		 375 aa  232  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  37.18 
 
 		 375 aa  232  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  37.44 
 
 		 375 aa  232  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  37.18 
 
 		 375 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  37.27 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  34.29 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  38.92 
 
 		 370 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  37.18 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  39.67 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  39.67 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  38.5 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  39.67 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  38.73 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  39.39 
 
 		 366 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  39.39 
 
 		 366 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  39.39 
 
 		 366 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  39.39 
 
 		 366 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>