239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0007 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  90.76 
 
 		 358 aa  667    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 358 aa  730    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  91.34 
 
 		 358 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  64.41 
 
 		 354 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  60.5 
 
 		 368 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  61.8 
 
 		 358 aa  418  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  62.22 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  49.86 
 
 		 373 aa  332  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  48.93 
 
 		 381 aa  325  8.000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  49.01 
 
 		 379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  50 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  49.31 
 
 		 397 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  48.19 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  45.9 
 
 		 395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  49.59 
 
 		 416 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  46.49 
 
 		 390 aa  298  9e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  45.73 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  43.85 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  44.63 
 
 		 409 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  46.01 
 
 		 410 aa  285  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  46.7 
 
 		 404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  42.94 
 
 		 393 aa  282  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  43.62 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  42.78 
 
 		 387 aa  278  9e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  45.88 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  42.23 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  45.58 
 
 		 377 aa  276  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  45.6 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  42.23 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  42.28 
 
 		 397 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  41.35 
 
 		 394 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  45.45 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  41.46 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  41.96 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  41.44 
 
 		 394 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  41.46 
 
 		 387 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  42.82 
 
 		 386 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  41.27 
 
 		 393 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  43.84 
 
 		 392 aa  259  7e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  39.78 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  40.73 
 
 		 371 aa  255  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  40.72 
 
 		 393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  39.55 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  38.87 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  39.28 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  38.87 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  38.87 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  38.87 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  38.87 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  38.87 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  38.87 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  39.28 
 
 		 367 aa  243  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  38.59 
 
 		 365 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  39.28 
 
 		 367 aa  243  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  38.59 
 
 		 365 aa  242  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  38.87 
 
 		 365 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  38.59 
 
 		 383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  38.03 
 
 		 365 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  38.31 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  39.04 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  39.15 
 
 		 366 aa  239  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  38.48 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  35.57 
 
 		 372 aa  238  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  37.15 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  38.14 
 
 		 365 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  38.94 
 
 		 365 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  39 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  37.75 
 
 		 365 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  37.75 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  37.75 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  37.75 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  35.71 
 
 		 403 aa  235  7e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  38.7 
 
 		 365 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  40.06 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07029  mitochondrial ATPase (Afg1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04130)  38.38 
 
 		 653 aa  231  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  36.62 
 
 		 365 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  38.7 
 
 		 367 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  38.14 
 
 		 367 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  36.9 
 
 		 365 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  38.03 
 
 		 361 aa  229  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  34.38 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  36.44 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  36.11 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  40.06 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  34.1 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  39 
 
 		 369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  37.64 
 
 		 370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  37.64 
 
 		 370 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  37.75 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  37.36 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  37.36 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  39.03 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  35.9 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  37.46 
 
 		 366 aa  224  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  35.75 
 
 		 370 aa  222  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  36.9 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0392  AFG1 family ATPase  38.94 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  39.8 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22398  predicted protein  37.15 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  37.08 
 
 		 377 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>