226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_22398 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_22398  predicted protein  100 
 
 
378 aa  778    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  43.33 
 
 
394 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  41.95 
 
 
393 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  43.43 
 
 
373 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  37.15 
 
 
358 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  41.64 
 
 
397 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  41.78 
 
 
393 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  44.19 
 
 
397 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  35.75 
 
 
358 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  41.83 
 
 
390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  42.62 
 
 
416 aa  215  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  35.96 
 
 
358 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  40.4 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  40.53 
 
 
393 aa  212  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  42.57 
 
 
409 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  42 
 
 
404 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  36.26 
 
 
389 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  38.89 
 
 
410 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  42 
 
 
387 aa  210  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2542  predicted protein  37.78 
 
 
417 aa  209  7e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  41.72 
 
 
403 aa  208  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  39.21 
 
 
394 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  40.74 
 
 
379 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  42.9 
 
 
381 aa  206  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  37.77 
 
 
387 aa  206  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  35.12 
 
 
358 aa  205  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  35.81 
 
 
368 aa  205  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  40.2 
 
 
372 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  43.14 
 
 
386 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  41.55 
 
 
392 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  38.59 
 
 
404 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  41.81 
 
 
387 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  41.25 
 
 
394 aa  202  9e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07029  mitochondrial ATPase (Afg1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04130)  35.25 
 
 
653 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  38.02 
 
 
404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  37.74 
 
 
404 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01350  hypothetical protein  34.85 
 
 
521 aa  195  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  40 
 
 
387 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  35.69 
 
 
354 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  42.11 
 
 
371 aa  192  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  37 
 
 
382 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  34.81 
 
 
403 aa  187  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  37.34 
 
 
377 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  40.73 
 
 
395 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  35.24 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0392  AFG1 family ATPase  32.2 
 
 
351 aa  184  3e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  38.61 
 
 
372 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86016  ATPase  33.33 
 
 
492 aa  180  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3538  predicted protein  35.11 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.366937  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  32.53 
 
 
391 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  32.87 
 
 
377 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  31.61 
 
 
360 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  31.96 
 
 
376 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0624  AFG1-like ATPase  30.51 
 
 
351 aa  171  3e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.208212  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  30.97 
 
 
341 aa  169  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  34.18 
 
 
366 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  33.96 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  33.11 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  33.67 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  32.88 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  33.96 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  33.77 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  33.22 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  32.32 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  32.61 
 
 
374 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  31.65 
 
 
376 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  31.34 
 
 
376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  32.49 
 
 
375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  32.61 
 
 
374 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  35.06 
 
 
365 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  33.33 
 
 
366 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  33.33 
 
 
361 aa  163  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  32.61 
 
 
374 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  31.92 
 
 
375 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  34.75 
 
 
367 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  34.2 
 
 
365 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  31.92 
 
 
375 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  33.05 
 
 
375 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  33.05 
 
 
375 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  33.05 
 
 
375 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  30.83 
 
 
368 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  33.05 
 
 
375 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  31.92 
 
 
375 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  32.2 
 
 
375 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  32.14 
 
 
372 aa  160  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  32.6 
 
 
371 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  32.61 
 
 
374 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  32.22 
 
 
365 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  33.23 
 
 
365 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  33.44 
 
 
371 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  32.28 
 
 
367 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  32.58 
 
 
374 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1096  AFG1 family ATPase  30.75 
 
 
361 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352008  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  29.75 
 
 
372 aa  157  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2359  AFG1-family ATPase  35.97 
 
 
358 aa  157  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88075  predicted protein  36.98 
 
 
462 aa  155  8e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.176065  normal  0.458743 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  35.97 
 
 
365 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  34.19 
 
 
365 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  35.97 
 
 
366 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  35.97 
 
 
366 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>