233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1096 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1096  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 361 aa  746    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  37.39 
 
 		 389 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  36.77 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  38.2 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  38.03 
 
 		 358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  37.71 
 
 		 358 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  36.41 
 
 		 397 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  35.55 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  37.71 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  35.55 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  35.55 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  35.55 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  35.38 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  35.97 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  35.55 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  35.83 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  35.76 
 
 		 365 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  35.65 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  35.97 
 
 		 366 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  35.97 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  32 
 
 		 383 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  34.67 
 
 		 358 aa  210  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  33.7 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  37.77 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  35.1 
 
 		 403 aa  208  9e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  32.04 
 
 		 377 aa  208  9e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  32.58 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  32.58 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  35.2 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  34.87 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  35.86 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  35.86 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  34.87 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  35 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  36.45 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  35.02 
 
 		 365 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  36.19 
 
 		 390 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  34.87 
 
 		 365 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  34.87 
 
 		 365 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  35.71 
 
 		 393 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  37.67 
 
 		 367 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  37.37 
 
 		 366 aa  205  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  36.77 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  35.85 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  34.21 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  37.99 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  34.42 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  34.36 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  33.52 
 
 		 364 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  34.83 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  36.09 
 
 		 416 aa  203  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  34.69 
 
 		 394 aa  202  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  38.64 
 
 		 372 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  38.28 
 
 		 393 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  37.4 
 
 		 404 aa  202  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  34.93 
 
 		 409 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  36.12 
 
 		 367 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  35.38 
 
 		 395 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  35.47 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  34.63 
 
 		 365 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  34.44 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  34.01 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  35.1 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  34.41 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  36.27 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  37.12 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  33.8 
 
 		 368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  40.34 
 
 		 371 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  35.29 
 
 		 410 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  33.52 
 
 		 364 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  39.12 
 
 		 360 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  34.49 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  34.92 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  33.69 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  33.85 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  38.28 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  35.19 
 
 		 404 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  32.6 
 
 		 374 aa  196  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  32.43 
 
 		 405 aa  196  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  34.23 
 
 		 366 aa  196  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  29.57 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  33.7 
 
 		 382 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  32.95 
 
 		 393 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  32.7 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  34.18 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  31.59 
 
 		 364 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  31.97 
 
 		 367 aa  193  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  31.35 
 
 		 371 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  31.59 
 
 		 364 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  31.59 
 
 		 364 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2713  hypothetical protein  31.21 
 
 		 360 aa  192  8e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  35.02 
 
 		 367 aa  192  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  29.75 
 
 		 373 aa  192  9e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  32.41 
 
 		 400 aa  192  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  33.15 
 
 		 374 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3756  ATPase  34.99 
 
 		 361 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  33.15 
 
 		 374 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  33.15 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2586  hypothetical protein  30.92 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  33.24 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>