233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0839 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3756  ATPase  86.4 
 
 		 361 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  93.25 
 
 		 400 aa  772    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0870  AFG1 family ATPase  90.27 
 
 		 401 aa  744    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 400 aa  826    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3439  AFG1 family ATPase  71.5 
 
 		 431 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0922  AFG1-family ATPase  71.5 
 
 		 431 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.758989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  71.67 
 
 		 405 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0932  AFG1 family ATPase  70.41 
 
 		 439 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0898  AFG1 family ATPase  71.01 
 
 		 417 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1575  AFG1 family ATPase  68.72 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417886  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2704  AFG1-like ATPase  66.58 
 
 		 412 aa  527  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.157464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3257  AFG1 family ATPase  56.22 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0734  AFG1 family ATPase  58.53 
 
 		 375 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  55.67 
 
 		 388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3826  AFG1 family ATPase  53.54 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2522  AFG1-like ATPase  52.39 
 
 		 411 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3797  AFG1 family ATPase  52.07 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.10446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2660  AFG1-like ATPase  57.31 
 
 		 373 aa  358  7e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  42.21 
 
 		 377 aa  306  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  44.22 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  43.42 
 
 		 374 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  43.72 
 
 		 364 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  43.26 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3466  AFG1 family ATPase  55.56 
 
 		 285 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  43.47 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  42.75 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  43 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  41.56 
 
 		 366 aa  292  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  43.29 
 
 		 368 aa  292  9e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  42.46 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  41.96 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  42.21 
 
 		 364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  44.39 
 
 		 368 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  44.35 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  42.37 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  43.75 
 
 		 369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  43.72 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  42.75 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  44.59 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  44.83 
 
 		 367 aa  280  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  42.51 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  47.04 
 
 		 341 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  42.61 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  42.82 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  42.26 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  43.07 
 
 		 372 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  42.61 
 
 		 370 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  42.61 
 
 		 370 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  42.25 
 
 		 370 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  41.9 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  38.9 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3538  AFG1 family ATPase  44.16 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  40.05 
 
 		 367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  42.86 
 
 		 370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  42.78 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  40.4 
 
 		 391 aa  272  7e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  41.77 
 
 		 368 aa  272  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  41.88 
 
 		 369 aa  272  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23860  ATPase  42.46 
 
 		 401 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3362  AFG1-like ATPase  41.51 
 
 		 371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  41.46 
 
 		 368 aa  269  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  41.76 
 
 		 366 aa  269  7e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3592  ATPase, putative  43.24 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.907313  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2579  AFG1-like ATPase  40.99 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  40.97 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  39.95 
 
 		 368 aa  266  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  41.69 
 
 		 360 aa  266  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  41.98 
 
 		 361 aa  265  7e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  38.78 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  38.78 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  40.99 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  38.78 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  40.2 
 
 		 384 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  38.81 
 
 		 367 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  40.2 
 
 		 365 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  38.06 
 
 		 367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  36.34 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  36.34 
 
 		 365 aa  252  6e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  36.55 
 
 		 372 aa  252  9.000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  38.33 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  37.62 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  40.05 
 
 		 375 aa  250  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  39.8 
 
 		 375 aa  249  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  43 
 
 		 360 aa  249  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  39.29 
 
 		 375 aa  246  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  39.29 
 
 		 375 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  36.63 
 
 		 376 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  39.53 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  39.53 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  39.53 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  39.79 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  39.53 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  40.1 
 
 		 374 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  36.43 
 
 		 373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  36.43 
 
 		 373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  40.1 
 
 		 374 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  36.3 
 
 		 376 aa  243  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  39.85 
 
 		 374 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  38.03 
 
 		 365 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  39.85 
 
 		 374 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>