233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_23860 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_23860  ATPase  100 
 
 
401 aa  817    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  68.92 
 
 
384 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2579  AFG1-like ATPase  68.75 
 
 
372 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  68.92 
 
 
384 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  70.92 
 
 
369 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  63.61 
 
 
368 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3362  AFG1-like ATPase  63.41 
 
 
371 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140427  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3592  ATPase, putative  64.23 
 
 
371 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.907313  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  62.53 
 
 
368 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  62.16 
 
 
368 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3538  AFG1 family ATPase  61.99 
 
 
368 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  44.39 
 
 
388 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0734  AFG1 family ATPase  42.7 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3826  AFG1 family ATPase  41.91 
 
 
406 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  44.11 
 
 
400 aa  279  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1575  AFG1 family ATPase  42.04 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417886  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3797  AFG1 family ATPase  43.36 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.10446  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  42.46 
 
 
400 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0870  AFG1 family ATPase  42.45 
 
 
401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3257  AFG1 family ATPase  40.2 
 
 
405 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2660  AFG1-like ATPase  46.23 
 
 
373 aa  260  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  40.2 
 
 
405 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3756  ATPase  42.54 
 
 
361 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2522  AFG1-like ATPase  40.4 
 
 
411 aa  254  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0898  AFG1 family ATPase  37.71 
 
 
417 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3439  AFG1 family ATPase  37.74 
 
 
431 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0922  AFG1-family ATPase  37.5 
 
 
431 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.758989  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0932  AFG1 family ATPase  37.06 
 
 
439 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  36.71 
 
 
375 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  36.71 
 
 
375 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  36.71 
 
 
375 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  38.58 
 
 
369 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2704  AFG1-like ATPase  39.46 
 
 
412 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.157464  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  36.2 
 
 
373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  36.2 
 
 
373 aa  241  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  37.01 
 
 
368 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  34.9 
 
 
372 aa  237  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  35.86 
 
 
376 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  36.46 
 
 
367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  36.23 
 
 
391 aa  236  6e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  39.07 
 
 
372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  35.49 
 
 
377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  34.03 
 
 
371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  37.5 
 
 
368 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  36.32 
 
 
368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  36.09 
 
 
393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  36.96 
 
 
374 aa  233  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  39.82 
 
 
341 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  36.39 
 
 
365 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  36.8 
 
 
383 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  36.2 
 
 
367 aa  230  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  36.32 
 
 
374 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  36.32 
 
 
374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  36.29 
 
 
383 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  35.28 
 
 
375 aa  226  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  35.28 
 
 
375 aa  226  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  35.28 
 
 
375 aa  226  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  35.28 
 
 
375 aa  226  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  36.32 
 
 
374 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  35.61 
 
 
376 aa  225  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  35.03 
 
 
375 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  35.97 
 
 
374 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  36.34 
 
 
364 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  35.6 
 
 
370 aa  225  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  36.6 
 
 
365 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  35.03 
 
 
375 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  35.03 
 
 
375 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  36.95 
 
 
364 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  36.91 
 
 
370 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  36.57 
 
 
374 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  36.32 
 
 
374 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  36.65 
 
 
370 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  36.65 
 
 
370 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  35.11 
 
 
375 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  35.03 
 
 
375 aa  224  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  36.65 
 
 
386 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  36.65 
 
 
370 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  35.75 
 
 
367 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  36.39 
 
 
370 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  36.65 
 
 
386 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  36.18 
 
 
364 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  36.36 
 
 
368 aa  223  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  36.65 
 
 
370 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  36.17 
 
 
365 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  36.91 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  36.18 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  36.34 
 
 
365 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  36.18 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  36.87 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  35.96 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  34.46 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  35.96 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  36.39 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  32.98 
 
 
392 aa  219  6e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  35.84 
 
 
364 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  32.72 
 
 
365 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  37.57 
 
 
365 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  38.37 
 
 
339 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  36.51 
 
 
365 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  35.59 
 
 
376 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>