232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0898 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0932  AFG1 family ATPase  94.54 
 
 
439 aa  821    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0898  AFG1 family ATPase  100 
 
 
417 aa  867    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0922  AFG1-family ATPase  96.4 
 
 
431 aa  840    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.758989  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3439  AFG1 family ATPase  96.88 
 
 
431 aa  846    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  78.02 
 
 
405 aa  655    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  71.01 
 
 
400 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0870  AFG1 family ATPase  70.05 
 
 
401 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  70.05 
 
 
400 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3756  ATPase  73.18 
 
 
361 aa  555  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1575  AFG1 family ATPase  64.23 
 
 
396 aa  546  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417886  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2704  AFG1-like ATPase  60.1 
 
 
412 aa  508  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.157464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0734  AFG1 family ATPase  52.87 
 
 
375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3257  AFG1 family ATPase  51.17 
 
 
405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  52.38 
 
 
388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3826  AFG1 family ATPase  50.72 
 
 
406 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2522  AFG1-like ATPase  49.65 
 
 
411 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3797  AFG1 family ATPase  48.09 
 
 
379 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.10446  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2660  AFG1-like ATPase  50 
 
 
373 aa  345  8e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  40.32 
 
 
374 aa  298  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  41.27 
 
 
364 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  39.91 
 
 
377 aa  292  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  41.13 
 
 
364 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  38.64 
 
 
366 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  40.33 
 
 
364 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3466  AFG1 family ATPase  51.46 
 
 
285 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  40.9 
 
 
364 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  41.3 
 
 
393 aa  289  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  40.09 
 
 
364 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  39.81 
 
 
364 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  40.33 
 
 
364 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  39.58 
 
 
364 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  38.59 
 
 
368 aa  286  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  39.86 
 
 
364 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  38.59 
 
 
369 aa  285  8e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  38.97 
 
 
370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  39.44 
 
 
370 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  39.91 
 
 
370 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  39.91 
 
 
370 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  39.91 
 
 
370 aa  279  8e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  40.05 
 
 
386 aa  278  9e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  39.67 
 
 
370 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  39.81 
 
 
388 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  38.3 
 
 
368 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  39.81 
 
 
386 aa  276  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  38.5 
 
 
370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  38.92 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  41.53 
 
 
339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  38.85 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  38.88 
 
 
370 aa  274  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  38.44 
 
 
368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  39.29 
 
 
367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  36.6 
 
 
371 aa  273  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  38.76 
 
 
368 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  36.73 
 
 
391 aa  269  8.999999999999999e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  39.27 
 
 
368 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  37.86 
 
 
360 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  37.3 
 
 
368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  37.93 
 
 
368 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3362  AFG1-like ATPase  38.11 
 
 
371 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140427  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  38.5 
 
 
365 aa  266  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3538  AFG1 family ATPase  39 
 
 
368 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  39.13 
 
 
384 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  37.24 
 
 
372 aa  263  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  39.17 
 
 
369 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  36.21 
 
 
367 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  40.26 
 
 
341 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  39.08 
 
 
384 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  37.74 
 
 
366 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3592  ATPase, putative  40.06 
 
 
371 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.907313  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  37.15 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2579  AFG1-like ATPase  35.73 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23860  ATPase  37.71 
 
 
401 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  36.99 
 
 
361 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  35.31 
 
 
392 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  35.31 
 
 
365 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  39.95 
 
 
360 aa  249  5e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  35.75 
 
 
367 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  36.79 
 
 
365 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  34.77 
 
 
372 aa  240  4e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  33.72 
 
 
376 aa  239  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  33.81 
 
 
373 aa  236  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  35.22 
 
 
365 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  35.92 
 
 
375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  35.92 
 
 
375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  33.81 
 
 
373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  35.92 
 
 
375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1195  ATPase  34.6 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.871526  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1103  AFG1 family ATPase  34.6 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  36.05 
 
 
365 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  34.48 
 
 
376 aa  234  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  35.42 
 
 
375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  35.19 
 
 
375 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  35.8 
 
 
365 aa  230  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  35.08 
 
 
367 aa  230  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  35.56 
 
 
365 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  34.99 
 
 
365 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  34.72 
 
 
375 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  35.42 
 
 
375 aa  229  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  34.72 
 
 
375 aa  229  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  35.42 
 
 
375 aa  229  7e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>