232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3756 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3756  ATPase  100 
 
 		 361 aa  750    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  86.69 
 
 		 400 aa  638    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0870  AFG1 family ATPase  86.16 
 
 		 401 aa  636    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  86.4 
 
 		 400 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0922  AFG1-family ATPase  73.96 
 
 		 431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.758989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3439  AFG1 family ATPase  73.96 
 
 		 431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0932  AFG1 family ATPase  71.98 
 
 		 439 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0898  AFG1 family ATPase  73.18 
 
 		 417 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  78.59 
 
 		 405 aa  556  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1575  AFG1 family ATPase  70.95 
 
 		 396 aa  527  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417886  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2704  AFG1-like ATPase  65.3 
 
 		 412 aa  491  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.157464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0734  AFG1 family ATPase  60.17 
 
 		 375 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  58.82 
 
 		 388 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3257  AFG1 family ATPase  55.97 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3826  AFG1 family ATPase  55.99 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2522  AFG1-like ATPase  57.97 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3797  AFG1 family ATPase  56.68 
 
 		 379 aa  360  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.10446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2660  AFG1-like ATPase  56.59 
 
 		 373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3466  AFG1 family ATPase  56.64 
 
 		 285 aa  294  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  44.28 
 
 		 377 aa  289  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  45.01 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  45.35 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  45.01 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  44.44 
 
 		 364 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  45.75 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  45.03 
 
 		 368 aa  279  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  44.67 
 
 		 339 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  45.64 
 
 		 364 aa  278  9e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  44.77 
 
 		 364 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  45.64 
 
 		 364 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  43.59 
 
 		 364 aa  275  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  46.45 
 
 		 341 aa  275  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  41.48 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  43.06 
 
 		 364 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  45.56 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  43.8 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  43.52 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  43.23 
 
 		 370 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  42.82 
 
 		 370 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  43.52 
 
 		 386 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  42.82 
 
 		 370 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  43.23 
 
 		 370 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  43.23 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  43.86 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  44.61 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  45.43 
 
 		 368 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3592  ATPase, putative  42.24 
 
 		 371 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.907313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  45.38 
 
 		 369 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  42.94 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3362  AFG1-like ATPase  41.95 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  42.86 
 
 		 391 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2579  AFG1-like ATPase  43.02 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  43.92 
 
 		 370 aa  263  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  46.27 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  44.91 
 
 		 367 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  41.79 
 
 		 371 aa  262  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  43.35 
 
 		 368 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  42.41 
 
 		 370 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  42.74 
 
 		 360 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  43.02 
 
 		 368 aa  260  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  43.41 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  44.48 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3538  AFG1 family ATPase  45.56 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  44.21 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  43.32 
 
 		 361 aa  256  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23860  ATPase  42.54 
 
 		 401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  41.33 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  43.92 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  42.11 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  41.91 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  41.03 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  41.95 
 
 		 375 aa  249  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  41.67 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  41.67 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  39.48 
 
 		 373 aa  247  3e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  39.48 
 
 		 373 aa  246  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  40.97 
 
 		 375 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  40.97 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  40.69 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  40.69 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  40.69 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  40.69 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  38.38 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  39.71 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  38.38 
 
 		 374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  38.38 
 
 		 374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  38.38 
 
 		 374 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  39.23 
 
 		 367 aa  239  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  38.29 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  39.77 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  39.77 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  39.77 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  40.6 
 
 		 365 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  40.06 
 
 		 374 aa  237  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  42.77 
 
 		 360 aa  236  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  39.23 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  38.12 
 
 		 374 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  38.53 
 
 		 372 aa  235  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  38.22 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  39.53 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>