233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2704 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2704  AFG1-like ATPase  100 
 
 		 412 aa  857    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.157464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1575  AFG1 family ATPase  66.67 
 
 		 396 aa  564  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417886  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  65.09 
 
 		 400 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  65.34 
 
 		 400 aa  535  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  65.24 
 
 		 405 aa  537  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0870  AFG1 family ATPase  64.43 
 
 		 401 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3439  AFG1 family ATPase  59.43 
 
 		 431 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0922  AFG1-family ATPase  59.2 
 
 		 431 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.758989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0932  AFG1 family ATPase  58.64 
 
 		 439 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0898  AFG1 family ATPase  59.62 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3756  ATPase  65.3 
 
 		 361 aa  491  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3257  AFG1 family ATPase  51.85 
 
 		 405 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2522  AFG1-like ATPase  50.97 
 
 		 411 aa  381  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  51.52 
 
 		 388 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3797  AFG1 family ATPase  51.92 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.10446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0734  AFG1 family ATPase  52.82 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3826  AFG1 family ATPase  50.13 
 
 		 406 aa  364  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2660  AFG1-like ATPase  54.13 
 
 		 373 aa  348  9e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  42.33 
 
 		 370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  43.32 
 
 		 370 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  43.32 
 
 		 370 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  43.07 
 
 		 370 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  42.64 
 
 		 369 aa  285  8e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  43.07 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  42.82 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  43.69 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  42.71 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  42.33 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  41.79 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  42.33 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  40.1 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  42.33 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  43.43 
 
 		 384 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  41.35 
 
 		 367 aa  279  7e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  39.85 
 
 		 364 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  42.53 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  40.84 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  42.67 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  39.85 
 
 		 364 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  40.59 
 
 		 368 aa  277  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  40.3 
 
 		 368 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  41 
 
 		 368 aa  276  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  40.15 
 
 		 366 aa  275  8e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  41.35 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  39.85 
 
 		 374 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  41.25 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  40.45 
 
 		 393 aa  274  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  39.85 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  39.6 
 
 		 364 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  40.35 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  40.55 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  40.35 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  39.4 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  39.51 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  39.51 
 
 		 365 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  41.78 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3466  AFG1 family ATPase  51.04 
 
 		 285 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2579  AFG1-like ATPase  40.36 
 
 		 372 aa  269  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  45.48 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3362  AFG1-like ATPase  39.18 
 
 		 371 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3538  AFG1 family ATPase  41.39 
 
 		 368 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  38.86 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  39.66 
 
 		 371 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  40.05 
 
 		 368 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3592  ATPase, putative  39.95 
 
 		 371 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.907313  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  39.41 
 
 		 368 aa  262  8e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  39.51 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  38.81 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  40.84 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  41.6 
 
 		 360 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  44.31 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  36.05 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23860  ATPase  38.93 
 
 		 401 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  36.63 
 
 		 367 aa  249  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  41.04 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  37.5 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  37.5 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  37.5 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  37.99 
 
 		 365 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  36.36 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  39.03 
 
 		 365 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  37.23 
 
 		 372 aa  243  6e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  36.94 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  36.94 
 
 		 366 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  36.94 
 
 		 366 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  38.82 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  36.68 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  36.2 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  36.94 
 
 		 365 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  36.68 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  36.68 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  36.68 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  36.68 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  37.41 
 
 		 375 aa  236  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  38.99 
 
 		 360 aa  236  8e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  35.88 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  37.9 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  34.72 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  36.09 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  37.16 
 
 		 375 aa  234  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>