233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1823 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  90.76 
 
 		 368 aa  683    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3538  AFG1 family ATPase  90.22 
 
 		 368 aa  668    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 368 aa  745    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  82.07 
 
 		 368 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2579  AFG1-like ATPase  67.12 
 
 		 372 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  64.86 
 
 		 384 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  64.86 
 
 		 384 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  66.48 
 
 		 369 aa  484  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23860  ATPase  63.61 
 
 		 401 aa  484  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3362  AFG1-like ATPase  61.14 
 
 		 371 aa  474  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140427  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3592  ATPase, putative  62.5 
 
 		 371 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.907313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  45.97 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3826  AFG1 family ATPase  41.32 
 
 		 406 aa  301  9e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0734  AFG1 family ATPase  43.63 
 
 		 375 aa  296  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2660  AFG1-like ATPase  46.45 
 
 		 373 aa  292  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  43.72 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1575  AFG1 family ATPase  41.97 
 
 		 396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417886  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  41.45 
 
 		 405 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  43.93 
 
 		 400 aa  279  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3797  AFG1 family ATPase  41.46 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.10446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3257  AFG1 family ATPase  41.19 
 
 		 405 aa  277  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2704  AFG1-like ATPase  42.71 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.157464  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0870  AFG1 family ATPase  43.08 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2522  AFG1-like ATPase  42.16 
 
 		 411 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3756  ATPase  45.56 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0932  AFG1 family ATPase  39.71 
 
 		 439 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0922  AFG1-family ATPase  38.48 
 
 		 431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.758989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3439  AFG1 family ATPase  38.67 
 
 		 431 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0898  AFG1 family ATPase  37.93 
 
 		 417 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  38.95 
 
 		 369 aa  264  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  34.61 
 
 		 373 aa  256  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  34.61 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  36.86 
 
 		 368 aa  252  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  38.79 
 
 		 368 aa  252  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  37.47 
 
 		 368 aa  248  9e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  38.85 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  39.11 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  38.85 
 
 		 370 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  37.14 
 
 		 370 aa  247  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  39.59 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  36.1 
 
 		 377 aa  245  8e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  38.58 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  38.32 
 
 		 370 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  37.8 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  38.32 
 
 		 370 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  38.32 
 
 		 370 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  38.32 
 
 		 370 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  38.58 
 
 		 386 aa  242  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  38.32 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  35.94 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  38.18 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  34.38 
 
 		 372 aa  240  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  35.96 
 
 		 365 aa  240  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  36.76 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  40.9 
 
 		 360 aa  237  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  41.67 
 
 		 341 aa  236  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  37.04 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  35.68 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  35.68 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  35.53 
 
 		 374 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  35.61 
 
 		 375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  35.61 
 
 		 375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  35.61 
 
 		 375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  36.88 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  37.14 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  36.72 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  36.62 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  36.62 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  32.46 
 
 		 392 aa  229  4e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  35.81 
 
 		 365 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  36.36 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  34.46 
 
 		 366 aa  229  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  35.51 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  39.39 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  32.45 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  36.77 
 
 		 365 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  35.26 
 
 		 376 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  36.94 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  36.77 
 
 		 366 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  36.36 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  33.5 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  35.71 
 
 		 365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  36.51 
 
 		 365 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  36.51 
 
 		 366 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  36.51 
 
 		 365 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  35.88 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  36.24 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  35.62 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  35.88 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  35.88 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  35.88 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  35.66 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  36.24 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  36.24 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  36.24 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  36.05 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  37.77 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  35.39 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  35.73 
 
 		 367 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  35.62 
 
 		 365 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>