235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2660 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2660  AFG1-like ATPase  100 
 
 		 373 aa  762    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3826  AFG1 family ATPase  56.76 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0734  AFG1 family ATPase  56.16 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  56.74 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  54.77 
 
 		 400 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1575  AFG1 family ATPase  51.4 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417886  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0870  AFG1 family ATPase  54.64 
 
 		 401 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3257  AFG1 family ATPase  52.72 
 
 		 405 aa  361  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  53.37 
 
 		 405 aa  361  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0922  AFG1-family ATPase  50 
 
 		 431 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.758989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2522  AFG1-like ATPase  50.25 
 
 		 411 aa  359  3e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0932  AFG1 family ATPase  49.4 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3439  AFG1 family ATPase  50 
 
 		 431 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0898  AFG1 family ATPase  50 
 
 		 417 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3756  ATPase  56.59 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  54.67 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2704  AFG1-like ATPase  52.53 
 
 		 412 aa  352  8e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.157464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3797  AFG1 family ATPase  50 
 
 		 379 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.10446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  47.53 
 
 		 368 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  46.45 
 
 		 368 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  46.52 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3538  AFG1 family ATPase  46.98 
 
 		 368 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  45.45 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  45.72 
 
 		 384 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2579  AFG1-like ATPase  45.45 
 
 		 372 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3362  AFG1-like ATPase  43.32 
 
 		 371 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  39.69 
 
 		 377 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  45.53 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3592  ATPase, putative  41.6 
 
 		 371 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.907313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23860  ATPase  43.68 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  41.34 
 
 		 370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  41.19 
 
 		 370 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  45.31 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  41.71 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  38.6 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  40.93 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  44.55 
 
 		 368 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  40.93 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  40.93 
 
 		 370 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  41.58 
 
 		 369 aa  257  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  41.71 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  41.45 
 
 		 386 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  40.1 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  42.38 
 
 		 374 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  40.73 
 
 		 368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  41.19 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3466  AFG1 family ATPase  49.12 
 
 		 285 aa  250  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  41.16 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  43.61 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  42.47 
 
 		 367 aa  248  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  41.9 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  43.44 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  41.8 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  38.26 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  39.58 
 
 		 393 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  38.5 
 
 		 365 aa  247  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  38.26 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  38.26 
 
 		 364 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  35.51 
 
 		 365 aa  246  6e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  38.95 
 
 		 364 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  38.95 
 
 		 364 aa  245  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  35.25 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  41.72 
 
 		 364 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  39.88 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  44.34 
 
 		 372 aa  244  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  37.11 
 
 		 366 aa  243  6e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  40.21 
 
 		 365 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  38.68 
 
 		 364 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  38.79 
 
 		 364 aa  238  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  38.95 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  42.15 
 
 		 365 aa  238  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  42.63 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  37.73 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  39.18 
 
 		 366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  42.95 
 
 		 365 aa  235  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  42.95 
 
 		 365 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  38.03 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  40.68 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  41.3 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  39.01 
 
 		 361 aa  229  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  38.73 
 
 		 383 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  41.06 
 
 		 367 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  39.04 
 
 		 365 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  40.22 
 
 		 367 aa  229  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  39.04 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  40.38 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  41.56 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  41.56 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  36.98 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  38.77 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  38.77 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  41.56 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  41.56 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  41.56 
 
 		 365 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  37.63 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  38.71 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  41.25 
 
 		 365 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  40.92 
 
 		 375 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  41.25 
 
 		 366 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  41.25 
 
 		 366 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>