232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0922 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0898  AFG1 family ATPase  96.4 
 
 
417 aa  840    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  77.72 
 
 
405 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0932  AFG1 family ATPase  94.25 
 
 
439 aa  845    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0922  AFG1-family ATPase  100 
 
 
431 aa  897    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.758989  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3439  AFG1 family ATPase  98.61 
 
 
431 aa  882    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  71.5 
 
 
400 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0870  AFG1 family ATPase  70.26 
 
 
401 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  69.62 
 
 
400 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3756  ATPase  73.96 
 
 
361 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1575  AFG1 family ATPase  64.92 
 
 
396 aa  557  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417886  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2704  AFG1-like ATPase  59.95 
 
 
412 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.157464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3257  AFG1 family ATPase  51.64 
 
 
405 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  52.38 
 
 
388 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0734  AFG1 family ATPase  52.63 
 
 
375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3826  AFG1 family ATPase  51.31 
 
 
406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2522  AFG1-like ATPase  49.41 
 
 
411 aa  391  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3797  AFG1 family ATPase  48.19 
 
 
379 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.10446  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2660  AFG1-like ATPase  50 
 
 
373 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  41.51 
 
 
364 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  40.32 
 
 
374 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  39.73 
 
 
377 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  41.61 
 
 
364 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  41.37 
 
 
364 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3466  AFG1 family ATPase  51.78 
 
 
285 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  39.29 
 
 
366 aa  292  8e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  40.09 
 
 
364 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  41.36 
 
 
393 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  39.39 
 
 
364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  39.62 
 
 
364 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  40.57 
 
 
364 aa  289  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  39.39 
 
 
364 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  40 
 
 
364 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  39.2 
 
 
368 aa  285  8e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  38.79 
 
 
370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  38.73 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  40 
 
 
386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  38.97 
 
 
370 aa  282  9e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  39.72 
 
 
370 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  40 
 
 
388 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  39.72 
 
 
370 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  39.72 
 
 
370 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  39.77 
 
 
386 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  39.72 
 
 
370 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  39.39 
 
 
370 aa  279  8e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  37.79 
 
 
368 aa  279  8e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  39.15 
 
 
368 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  39.08 
 
 
372 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  39.67 
 
 
368 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  37.41 
 
 
391 aa  275  8e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  41.53 
 
 
339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  37.74 
 
 
368 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  38.81 
 
 
360 aa  273  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  40 
 
 
368 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  38.53 
 
 
367 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  38.52 
 
 
370 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  38.46 
 
 
384 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  38.48 
 
 
368 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  35.9 
 
 
371 aa  268  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  38.31 
 
 
384 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  37.76 
 
 
368 aa  267  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3538  AFG1 family ATPase  39.47 
 
 
368 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  36.45 
 
 
367 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3362  AFG1-like ATPase  37.62 
 
 
371 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140427  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  38.26 
 
 
365 aa  265  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  39.04 
 
 
369 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  36.85 
 
 
372 aa  262  8e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  40.26 
 
 
341 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2579  AFG1-like ATPase  35.97 
 
 
372 aa  259  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  37.5 
 
 
366 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  37.71 
 
 
361 aa  256  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3592  ATPase, putative  38.61 
 
 
371 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.907313  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  36.68 
 
 
367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23860  ATPase  37.5 
 
 
401 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  34.75 
 
 
392 aa  252  8.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  34.75 
 
 
365 aa  252  9.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  40.45 
 
 
360 aa  249  5e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  35.51 
 
 
367 aa  247  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  37.28 
 
 
365 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  34.53 
 
 
372 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  34.18 
 
 
376 aa  240  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  34.77 
 
 
373 aa  239  8e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  34.77 
 
 
373 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  36.44 
 
 
375 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  35.98 
 
 
365 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  36.44 
 
 
375 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  36.44 
 
 
375 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1195  ATPase  35.04 
 
 
390 aa  236  6e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.871526  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1103  AFG1 family ATPase  34.6 
 
 
390 aa  236  7e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  35.01 
 
 
375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  36.48 
 
 
365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  34.03 
 
 
376 aa  234  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  35.71 
 
 
371 aa  233  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  35.24 
 
 
365 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  36.45 
 
 
365 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  33.8 
 
 
383 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  34.78 
 
 
375 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  34.1 
 
 
375 aa  232  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  34.78 
 
 
375 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  34.78 
 
 
375 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  35.39 
 
 
367 aa  232  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>