232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0631 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 388 aa  795    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0734  AFG1 family ATPase  61.98 
 
 		 375 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3826  AFG1 family ATPase  58.91 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3439  AFG1 family ATPase  52.86 
 
 		 431 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0922  AFG1-family ATPase  52.38 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.758989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0898  AFG1 family ATPase  52.38 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0932  AFG1 family ATPase  52.47 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  55.67 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  55.87 
 
 		 405 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0870  AFG1 family ATPase  55.16 
 
 		 401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  55.19 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3756  ATPase  58.82 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1575  AFG1 family ATPase  54.68 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417886  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2704  AFG1-like ATPase  51.66 
 
 		 412 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.157464  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2522  AFG1-like ATPase  52.01 
 
 		 411 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2660  AFG1-like ATPase  60.12 
 
 		 373 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3797  AFG1 family ATPase  51.06 
 
 		 379 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.10446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3257  AFG1 family ATPase  51.49 
 
 		 405 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  45.5 
 
 		 377 aa  328  7e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  45.97 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  45.97 
 
 		 368 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  45.1 
 
 		 388 aa  315  7e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  46.49 
 
 		 369 aa  315  9e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  45.15 
 
 		 370 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  45.1 
 
 		 386 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  45.1 
 
 		 386 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  45.36 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  45.1 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  44.96 
 
 		 370 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  44.96 
 
 		 370 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  43.32 
 
 		 393 aa  309  5e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  44.96 
 
 		 370 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  44.33 
 
 		 364 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  43.56 
 
 		 364 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  45.6 
 
 		 368 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  44.96 
 
 		 370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  43.41 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  43.41 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  44.85 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  43.26 
 
 		 370 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  43.59 
 
 		 371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3538  AFG1 family ATPase  45.45 
 
 		 368 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  44.16 
 
 		 368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  43.04 
 
 		 374 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  44.3 
 
 		 370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  44.68 
 
 		 368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  43.08 
 
 		 367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  44.33 
 
 		 368 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  44.68 
 
 		 368 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  44.07 
 
 		 364 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  45.5 
 
 		 384 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  42.53 
 
 		 364 aa  299  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  41.19 
 
 		 391 aa  298  8e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  43 
 
 		 364 aa  298  9e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3362  AFG1-like ATPase  44.39 
 
 		 371 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  44.97 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3466  AFG1 family ATPase  53.68 
 
 		 285 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  41.56 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  43.01 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  43.8 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2579  AFG1-like ATPase  43.42 
 
 		 372 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  43.19 
 
 		 365 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23860  ATPase  44.39 
 
 		 401 aa  292  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  41.28 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  45.28 
 
 		 339 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  44.3 
 
 		 374 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  44.3 
 
 		 374 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  44.3 
 
 		 374 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  42.39 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  43.8 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  45.09 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  42.12 
 
 		 373 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  43.54 
 
 		 374 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3592  ATPase, putative  46.48 
 
 		 371 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.907313  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  41.43 
 
 		 368 aa  282  7.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  43.56 
 
 		 367 aa  282  7.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  41.62 
 
 		 365 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  43.23 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  41.62 
 
 		 365 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  41.88 
 
 		 365 aa  280  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  41.15 
 
 		 375 aa  279  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  41.15 
 
 		 375 aa  279  7e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  41.15 
 
 		 365 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  41.71 
 
 		 365 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  45.77 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  41.01 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  40.84 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  41.36 
 
 		 366 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  41.36 
 
 		 365 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  41.56 
 
 		 365 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  41.36 
 
 		 366 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  41.36 
 
 		 366 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  41.36 
 
 		 366 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  41.36 
 
 		 366 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  41.36 
 
 		 366 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  41.62 
 
 		 375 aa  276  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  41.62 
 
 		 375 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  41.62 
 
 		 375 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  40.84 
 
 		 365 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  40.84 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>