235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_34230 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  97.14 
 
 		 384 aa  755    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  776    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2579  AFG1-like ATPase  70.38 
 
 		 372 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23860  ATPase  68.92 
 
 		 401 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3362  AFG1-like ATPase  65.23 
 
 		 371 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  65.85 
 
 		 368 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3592  ATPase, putative  65.5 
 
 		 371 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.907313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  67.92 
 
 		 369 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  64.86 
 
 		 368 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3538  AFG1 family ATPase  65.41 
 
 		 368 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  63.98 
 
 		 368 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0734  AFG1 family ATPase  44.17 
 
 		 375 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3826  AFG1 family ATPase  41.88 
 
 		 406 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3797  AFG1 family ATPase  44.99 
 
 		 379 aa  296  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.10446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  44.97 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2660  AFG1-like ATPase  45.72 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  41.6 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2704  AFG1-like ATPase  43.88 
 
 		 412 aa  275  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.157464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1575  AFG1 family ATPase  40.76 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417886  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3257  AFG1 family ATPase  41.1 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3439  AFG1 family ATPase  38.7 
 
 		 431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0922  AFG1-family ATPase  38.46 
 
 		 431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.758989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0870  AFG1 family ATPase  40.77 
 
 		 401 aa  269  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  42.56 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0932  AFG1 family ATPase  39.05 
 
 		 439 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  40.97 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0898  AFG1 family ATPase  39.13 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2522  AFG1-like ATPase  41.06 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  40.57 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3756  ATPase  44.21 
 
 		 361 aa  256  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  38.64 
 
 		 365 aa  254  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  37.02 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  36.68 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  39.12 
 
 		 370 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  36.48 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  38.64 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  37.05 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  37.85 
 
 		 375 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  37.85 
 
 		 375 aa  246  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  37.56 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  37.85 
 
 		 375 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  39.49 
 
 		 372 aa  246  6e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  37.24 
 
 		 368 aa  245  9e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  37.5 
 
 		 368 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  33.67 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  37.47 
 
 		 386 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  38.18 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  37.56 
 
 		 370 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  38.08 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  37.56 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  37.56 
 
 		 370 aa  243  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  33.68 
 
 		 365 aa  242  6e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  42.04 
 
 		 341 aa  242  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  35.81 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  37.21 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  36.95 
 
 		 388 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  37.31 
 
 		 370 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  36.1 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  37.98 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  36.27 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  36.2 
 
 		 375 aa  237  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  36.2 
 
 		 375 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  36.2 
 
 		 375 aa  236  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  36.2 
 
 		 375 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  36.2 
 
 		 375 aa  236  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  36.2 
 
 		 375 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  36.2 
 
 		 375 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  36.01 
 
 		 370 aa  236  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  36.54 
 
 		 391 aa  235  8e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  36.04 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  35.59 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  36.81 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  35.95 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  35.59 
 
 		 374 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  36.34 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  35.29 
 
 		 377 aa  233  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  36.67 
 
 		 383 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  37.56 
 
 		 393 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  36.01 
 
 		 364 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  35.59 
 
 		 374 aa  232  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  36.01 
 
 		 364 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  35.86 
 
 		 374 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  35.34 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  36.08 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  35.98 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  35.19 
 
 		 374 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  36.34 
 
 		 365 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  35.34 
 
 		 374 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  38.32 
 
 		 365 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  34.02 
 
 		 372 aa  229  5e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  36.15 
 
 		 383 aa  229  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  36.34 
 
 		 364 aa  229  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  35.82 
 
 		 364 aa  229  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  35.82 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  36.94 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  36.07 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  38.26 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  36.73 
 
 		 376 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  35.79 
 
 		 376 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  36.51 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>