233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1575 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1575  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 396 aa  825    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417886  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0870  AFG1 family ATPase  70.31 
 
 		 401 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  68.72 
 
 		 400 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2704  AFG1-like ATPase  66.91 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.157464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  68.75 
 
 		 400 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3439  AFG1 family ATPase  64.92 
 
 		 431 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0922  AFG1-family ATPase  64.92 
 
 		 431 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.758989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0932  AFG1 family ATPase  63.44 
 
 		 439 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0898  AFG1 family ATPase  64.23 
 
 		 417 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  67.35 
 
 		 405 aa  543  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3756  ATPase  70.95 
 
 		 361 aa  527  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3257  AFG1 family ATPase  52.71 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  54.68 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0734  AFG1 family ATPase  54.55 
 
 		 375 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3826  AFG1 family ATPase  51.55 
 
 		 406 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3797  AFG1 family ATPase  52.07 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.10446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2522  AFG1-like ATPase  50.25 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2660  AFG1-like ATPase  51.4 
 
 		 373 aa  351  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  43.46 
 
 		 368 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  41.81 
 
 		 370 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  43.04 
 
 		 368 aa  285  7e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  40.74 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  41.97 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  41.31 
 
 		 370 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  41.88 
 
 		 364 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  41.31 
 
 		 370 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  40.4 
 
 		 368 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  41.56 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  41.62 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  40 
 
 		 393 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  41.56 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  40.81 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  39.85 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3538  AFG1 family ATPase  43.01 
 
 		 368 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  40.81 
 
 		 370 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  43.54 
 
 		 370 aa  279  7e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  40.81 
 
 		 370 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  41.53 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  40.81 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  41.06 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  39.85 
 
 		 364 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  39.6 
 
 		 374 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  41.16 
 
 		 369 aa  276  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  41.27 
 
 		 384 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  39.34 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23860  ATPase  42.04 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  40.76 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  42.56 
 
 		 368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  41.44 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  40.36 
 
 		 364 aa  273  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  39.65 
 
 		 364 aa  272  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  40.1 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  42.78 
 
 		 367 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  45 
 
 		 341 aa  269  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3362  AFG1-like ATPase  39.37 
 
 		 371 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  38.13 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  39.34 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  40.05 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3466  AFG1 family ATPase  51.22 
 
 		 285 aa  265  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  39.29 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  39.35 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  39.25 
 
 		 371 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  38.04 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  39.25 
 
 		 368 aa  263  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  38.04 
 
 		 365 aa  262  8e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3592  ATPase, putative  40.7 
 
 		 371 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.907313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  40.21 
 
 		 369 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  38.86 
 
 		 372 aa  259  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2579  AFG1-like ATPase  38.14 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  40.11 
 
 		 366 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  37.84 
 
 		 367 aa  255  9e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  41.11 
 
 		 391 aa  252  7e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  41.81 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  35.96 
 
 		 375 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  35.96 
 
 		 375 aa  249  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  35.96 
 
 		 375 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  37.76 
 
 		 373 aa  249  6e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  37.76 
 
 		 373 aa  249  8e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  40.68 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  38.21 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  36.36 
 
 		 367 aa  247  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  37.15 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  38.62 
 
 		 371 aa  245  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  39.59 
 
 		 360 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  38.5 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  37.98 
 
 		 367 aa  240  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  38.66 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  40.35 
 
 		 375 aa  239  8e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  39.83 
 
 		 375 aa  239  8e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  40.29 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  35.06 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  39.77 
 
 		 375 aa  236  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  39.22 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  39.77 
 
 		 375 aa  236  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  38.66 
 
 		 365 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  37.15 
 
 		 365 aa  236  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  38.66 
 
 		 366 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  38.66 
 
 		 366 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  38.66 
 
 		 366 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  38.66 
 
 		 366 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>