224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3466 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3466  AFG1 family ATPase  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0734  AFG1 family ATPase  58.74 
 
 
375 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3826  AFG1 family ATPase  56.99 
 
 
406 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  54.67 
 
 
405 aa  296  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  55.56 
 
 
400 aa  295  8e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3756  ATPase  56.64 
 
 
361 aa  294  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0922  AFG1-family ATPase  51.78 
 
 
431 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.758989  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3439  AFG1 family ATPase  51.78 
 
 
431 aa  292  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0898  AFG1 family ATPase  51.46 
 
 
417 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  53.33 
 
 
388 aa  289  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0932  AFG1 family ATPase  50.64 
 
 
439 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  55.02 
 
 
400 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0870  AFG1 family ATPase  53.47 
 
 
401 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3257  AFG1 family ATPase  53 
 
 
405 aa  271  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2704  AFG1-like ATPase  51.04 
 
 
412 aa  270  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.157464  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2522  AFG1-like ATPase  51.94 
 
 
411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1575  AFG1 family ATPase  51.22 
 
 
396 aa  265  5e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417886  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2660  AFG1-like ATPase  49.12 
 
 
373 aa  249  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3797  AFG1 family ATPase  45.96 
 
 
379 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.10446  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  40.78 
 
 
368 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3538  AFG1 family ATPase  40.43 
 
 
368 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  39.72 
 
 
368 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  41.75 
 
 
377 aa  205  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2579  AFG1-like ATPase  41.13 
 
 
372 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  41.84 
 
 
369 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3592  ATPase, putative  38.6 
 
 
371 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.907313  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  39.93 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  42.11 
 
 
364 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3362  AFG1-like ATPase  37.23 
 
 
371 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140427  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  43.51 
 
 
372 aa  195  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  40.7 
 
 
364 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  39.22 
 
 
384 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  39.65 
 
 
364 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  40.7 
 
 
339 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23860  ATPase  41.05 
 
 
401 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  40.35 
 
 
364 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  41.1 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  41.75 
 
 
364 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  39.22 
 
 
384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  41.1 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  41.4 
 
 
374 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  39.65 
 
 
393 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  40.35 
 
 
391 aa  189  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  39.65 
 
 
366 aa  188  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  41.46 
 
 
341 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  39.3 
 
 
368 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  39.65 
 
 
364 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  38.25 
 
 
366 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  40 
 
 
364 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  40.56 
 
 
369 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  37.54 
 
 
371 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  38.46 
 
 
370 aa  175  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  38.46 
 
 
370 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  38.95 
 
 
370 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  38.46 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  38.46 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  38.46 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  38.81 
 
 
386 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  38.81 
 
 
386 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  38.6 
 
 
365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  39.16 
 
 
368 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  38.81 
 
 
388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  39.16 
 
 
370 aa  172  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  37.5 
 
 
367 aa  172  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  38.25 
 
 
360 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  39.3 
 
 
368 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  37.76 
 
 
368 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  37.19 
 
 
360 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  37.76 
 
 
370 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  36.84 
 
 
372 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  37.19 
 
 
368 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1103  AFG1 family ATPase  36.01 
 
 
390 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1195  ATPase  35.66 
 
 
390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.871526  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  37.46 
 
 
376 aa  162  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  37.54 
 
 
367 aa  162  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  38.11 
 
 
376 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  35.79 
 
 
392 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  36.01 
 
 
376 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  36.84 
 
 
375 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  36.84 
 
 
375 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  36.84 
 
 
375 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  35.44 
 
 
365 aa  159  6e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  37.15 
 
 
374 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2713  hypothetical protein  35.44 
 
 
360 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  36.11 
 
 
373 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  36.36 
 
 
361 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  37.15 
 
 
375 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  37.15 
 
 
374 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  37.15 
 
 
374 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  37.15 
 
 
375 aa  156  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  37.15 
 
 
375 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  36.55 
 
 
371 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  37.15 
 
 
375 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  36.11 
 
 
373 aa  155  6e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  37.5 
 
 
374 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  36.81 
 
 
375 aa  155  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  36.9 
 
 
383 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  36.81 
 
 
375 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  36.81 
 
 
375 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  36.46 
 
 
374 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>