233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3269 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 369 aa  746    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23860  ATPase  70.92 
 
 		 401 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2579  AFG1-like ATPase  67.21 
 
 		 372 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  67.39 
 
 		 384 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  67.92 
 
 		 384 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  66.48 
 
 		 368 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  65.93 
 
 		 368 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3592  ATPase, putative  65.22 
 
 		 371 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.907313  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3538  AFG1 family ATPase  65.38 
 
 		 368 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3362  AFG1-like ATPase  63.59 
 
 		 371 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  63.74 
 
 		 368 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0734  AFG1 family ATPase  46.01 
 
 		 375 aa  300  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3826  AFG1 family ATPase  43.88 
 
 		 406 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3797  AFG1 family ATPase  44.93 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.10446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  45.31 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0870  AFG1 family ATPase  44.3 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  43.75 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  45.09 
 
 		 388 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2704  AFG1-like ATPase  42.67 
 
 		 412 aa  272  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.157464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3257  AFG1 family ATPase  41.75 
 
 		 405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2522  AFG1-like ATPase  42.57 
 
 		 411 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  41.71 
 
 		 405 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3756  ATPase  45.38 
 
 		 361 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0922  AFG1-family ATPase  39.04 
 
 		 431 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.758989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3439  AFG1 family ATPase  39.52 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2660  AFG1-like ATPase  46.63 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0898  AFG1 family ATPase  39.17 
 
 		 417 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1575  AFG1 family ATPase  40.21 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417886  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0932  AFG1 family ATPase  39.05 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  39.53 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  37.53 
 
 		 373 aa  249  7e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  37.53 
 
 		 373 aa  247  3e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  38.06 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  39.16 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  39.37 
 
 		 369 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  39.79 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  37.89 
 
 		 368 aa  236  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  37.7 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  38.01 
 
 		 370 aa  236  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  37.5 
 
 		 370 aa  236  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  38.29 
 
 		 377 aa  235  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  41.3 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  37.7 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  37.31 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  39.24 
 
 		 374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  37.31 
 
 		 386 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  37.5 
 
 		 367 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  37.31 
 
 		 388 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  38.96 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  39.22 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  39.22 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  35.58 
 
 		 371 aa  230  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  38.44 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  36.73 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  36.73 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  36.73 
 
 		 370 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  38.18 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  38.96 
 
 		 364 aa  229  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  37.73 
 
 		 367 aa  229  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  36.48 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  38.44 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  37.85 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  40 
 
 		 391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  35.75 
 
 		 370 aa  226  7e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  36.36 
 
 		 375 aa  225  8e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  36.36 
 
 		 375 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  36.36 
 
 		 375 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  36.6 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  38.17 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  38.18 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  37.92 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  39.89 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  40.49 
 
 		 339 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  39.07 
 
 		 372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  33.51 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  36.68 
 
 		 371 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  36.57 
 
 		 367 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  36.63 
 
 		 365 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  33.25 
 
 		 365 aa  219  6e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  36.94 
 
 		 365 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  36.46 
 
 		 383 aa  219  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  37.73 
 
 		 365 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  38.22 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  37.47 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  37.47 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  37.47 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  37.47 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  37.47 
 
 		 366 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  37.47 
 
 		 366 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  37.47 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  36.1 
 
 		 365 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  36.46 
 
 		 367 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  37.43 
 
 		 367 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  37.47 
 
 		 365 aa  216  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  35.99 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  37.96 
 
 		 365 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  35.95 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  36.46 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  37.24 
 
 		 366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  33.16 
 
 		 372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>