230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3257 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3257  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 405 aa  834    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2522  AFG1-like ATPase  62.04 
 
 		 411 aa  488  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0870  AFG1 family ATPase  55.77 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  56.22 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  55.05 
 
 		 400 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0922  AFG1-family ATPase  51.64 
 
 		 431 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.758989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0932  AFG1 family ATPase  50.58 
 
 		 439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0898  AFG1 family ATPase  51.17 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  53.14 
 
 		 405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3439  AFG1 family ATPase  51.64 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1575  AFG1 family ATPase  52.71 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417886  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3756  ATPase  55.97 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3826  AFG1 family ATPase  53.67 
 
 		 406 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0734  AFG1 family ATPase  53.21 
 
 		 375 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2704  AFG1-like ATPase  52 
 
 		 412 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.157464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  51.49 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2660  AFG1-like ATPase  52.84 
 
 		 373 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3797  AFG1 family ATPase  46.7 
 
 		 379 aa  339  4e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.10446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  42.16 
 
 		 368 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2579  AFG1-like ATPase  40.57 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  42.56 
 
 		 368 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  40.53 
 
 		 370 aa  278  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3362  AFG1-like ATPase  40 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  41.19 
 
 		 368 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3538  AFG1 family ATPase  42.16 
 
 		 368 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  41.83 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  41.1 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  41.83 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  41.1 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  41.91 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  41.79 
 
 		 388 aa  274  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  40.77 
 
 		 370 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  41.99 
 
 		 370 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  40.53 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3466  AFG1 family ATPase  53 
 
 		 285 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  40.53 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  40.29 
 
 		 370 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  41.75 
 
 		 369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  37.71 
 
 		 377 aa  269  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  41.56 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  39.6 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23860  ATPase  40.2 
 
 		 401 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  43.6 
 
 		 341 aa  267  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  39.11 
 
 		 364 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  39.36 
 
 		 364 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  41.22 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  39.45 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  39.45 
 
 		 364 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  39.56 
 
 		 364 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  37.17 
 
 		 366 aa  262  6e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  39.85 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  38.82 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  39.28 
 
 		 374 aa  260  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  42.93 
 
 		 368 aa  259  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3592  ATPase, putative  39.49 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.907313  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  39.11 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  38.63 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  38.88 
 
 		 370 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  38.86 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  39.8 
 
 		 367 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  41.03 
 
 		 368 aa  257  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  41.74 
 
 		 339 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  38.86 
 
 		 364 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  36.76 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  37.04 
 
 		 365 aa  249  6e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  37.53 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  39.75 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  37.29 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  37.65 
 
 		 371 aa  243  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  36.92 
 
 		 361 aa  242  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  35.38 
 
 		 372 aa  242  7.999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  37.68 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  37.32 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  35.27 
 
 		 366 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  36.39 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  36.67 
 
 		 367 aa  234  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  36.63 
 
 		 373 aa  233  6e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1195  ATPase  37.17 
 
 		 390 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.871526  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  35.45 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  36.39 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1103  AFG1 family ATPase  36.69 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  41.57 
 
 		 375 aa  230  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  37.44 
 
 		 375 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  37.44 
 
 		 375 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  37.44 
 
 		 375 aa  229  7e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  37.53 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  41.28 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  34.86 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  41.28 
 
 		 375 aa  226  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  41.28 
 
 		 375 aa  226  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  41.28 
 
 		 375 aa  226  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  35.91 
 
 		 365 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  41.28 
 
 		 375 aa  226  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  40.99 
 
 		 375 aa  225  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  36.14 
 
 		 374 aa  225  9e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  40.99 
 
 		 375 aa  225  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  40.99 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  35.48 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  37.28 
 
 		 367 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  35.32 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>