232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2522 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2522  AFG1-like ATPase  100 
 
 		 411 aa  852    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3257  AFG1 family ATPase  62.04 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  52.72 
 
 		 405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  52.39 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  52.39 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0922  AFG1-family ATPase  49.41 
 
 		 431 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.758989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0898  AFG1 family ATPase  49.65 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0870  AFG1 family ATPase  53.1 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0932  AFG1 family ATPase  49.07 
 
 		 439 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3439  AFG1 family ATPase  49.65 
 
 		 431 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3826  AFG1 family ATPase  51.63 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0734  AFG1 family ATPase  53.27 
 
 		 375 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3756  ATPase  57.97 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2704  AFG1-like ATPase  51.5 
 
 		 412 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.157464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  52.01 
 
 		 388 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1575  AFG1 family ATPase  50.25 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417886  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2660  AFG1-like ATPase  50.25 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3797  AFG1 family ATPase  45.84 
 
 		 379 aa  335  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.10446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  42.43 
 
 		 368 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  40.49 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  42.16 
 
 		 368 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2579  AFG1-like ATPase  41.69 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3466  AFG1 family ATPase  51.94 
 
 		 285 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3362  AFG1-like ATPase  41.04 
 
 		 371 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  40.5 
 
 		 393 aa  270  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  40.9 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  40.4 
 
 		 369 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  40.9 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  41.15 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  38.85 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  39.85 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  40.9 
 
 		 370 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  42.57 
 
 		 369 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  40.65 
 
 		 370 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  40.4 
 
 		 388 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3538  AFG1 family ATPase  42.93 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  40.9 
 
 		 386 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  39.43 
 
 		 368 aa  262  8e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  40.5 
 
 		 364 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  39.9 
 
 		 370 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  40.25 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3592  ATPase, putative  42.49 
 
 		 371 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.907313  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  41.16 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  39.9 
 
 		 370 aa  260  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  41.06 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  37.78 
 
 		 366 aa  259  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  39.63 
 
 		 368 aa  256  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  39.69 
 
 		 370 aa  256  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  38.62 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  38.79 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  37.78 
 
 		 374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  39.63 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  38.34 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  38.48 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23860  ATPase  40.4 
 
 		 401 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  37.99 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  37.99 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  36.14 
 
 		 365 aa  253  6e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  36.14 
 
 		 392 aa  253  6e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  39.31 
 
 		 361 aa  252  7e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  39.29 
 
 		 364 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  38.35 
 
 		 364 aa  249  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  41 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  38.21 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  38.29 
 
 		 364 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  37 
 
 		 373 aa  247  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  35.9 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  36.75 
 
 		 373 aa  246  6e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  40.64 
 
 		 341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  37.25 
 
 		 372 aa  243  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  36.57 
 
 		 368 aa  242  7.999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  38.31 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  37.31 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  36.97 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  37.03 
 
 		 360 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  36.16 
 
 		 371 aa  236  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  38.93 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1195  ATPase  35.71 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.871526  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1103  AFG1 family ATPase  35.24 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  37.73 
 
 		 365 aa  230  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  36.48 
 
 		 365 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  37.99 
 
 		 365 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  36.81 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  36.48 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  36.22 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  36.22 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  38.74 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  39.06 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  36.22 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  38.74 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  38.74 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  38.74 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  36.13 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  36.94 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  35.88 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  36.94 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  36.94 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  38.87 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  36.77 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  37.47 
 
 		 374 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>