231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86016 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_86016  ATPase  100 
 
 
492 aa  1027    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07029  mitochondrial ATPase (Afg1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04130)  47.82 
 
 
653 aa  411  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01350  hypothetical protein  40.25 
 
 
521 aa  322  9.000000000000001e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  36.05 
 
 
390 aa  217  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  33.49 
 
 
397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  35.34 
 
 
387 aa  212  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  35.34 
 
 
403 aa  212  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  37.2 
 
 
404 aa  212  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  34.1 
 
 
381 aa  210  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  33.86 
 
 
373 aa  209  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  34.66 
 
 
397 aa  207  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  30.67 
 
 
392 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  36.84 
 
 
371 aa  206  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  33.59 
 
 
394 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  38.53 
 
 
403 aa  204  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  34.29 
 
 
392 aa  202  8e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  35.71 
 
 
416 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  32.35 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  34.03 
 
 
365 aa  201  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  34.46 
 
 
404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  30.6 
 
 
395 aa  199  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  31.89 
 
 
393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  37.42 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  32.99 
 
 
382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  31.8 
 
 
393 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  37.7 
 
 
410 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  38.74 
 
 
389 aa  196  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  37.29 
 
 
387 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  31.7 
 
 
358 aa  196  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  38.46 
 
 
404 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  37.2 
 
 
409 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  38.46 
 
 
404 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  33.68 
 
 
387 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  31.95 
 
 
394 aa  194  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  37.21 
 
 
386 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3538  predicted protein  33.6 
 
 
319 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.366937  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22398  predicted protein  33.33 
 
 
378 aa  192  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2542  predicted protein  29.89 
 
 
417 aa  192  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  32.19 
 
 
358 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  32.07 
 
 
379 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  30.44 
 
 
368 aa  189  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  31.58 
 
 
375 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  31.58 
 
 
375 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  31.58 
 
 
375 aa  188  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  31.58 
 
 
375 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  31.93 
 
 
358 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  31.58 
 
 
375 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  31.32 
 
 
375 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  31.32 
 
 
375 aa  187  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  33.06 
 
 
394 aa  187  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  31.32 
 
 
375 aa  187  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  30.57 
 
 
372 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  35.57 
 
 
354 aa  186  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  32.55 
 
 
369 aa  186  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  31.32 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  30.53 
 
 
374 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  30.26 
 
 
374 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  30.53 
 
 
374 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  31.5 
 
 
365 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  30.61 
 
 
377 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  32.28 
 
 
360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  30.26 
 
 
374 aa  183  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  33.18 
 
 
377 aa  183  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  31.23 
 
 
374 aa  180  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  30.26 
 
 
374 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  31.94 
 
 
391 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  33.23 
 
 
372 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  35.02 
 
 
371 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  29.92 
 
 
364 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  35.69 
 
 
371 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  30 
 
 
374 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  31.84 
 
 
368 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  30.79 
 
 
364 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  32.19 
 
 
393 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  31.2 
 
 
358 aa  176  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  32.8 
 
 
365 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  30.45 
 
 
368 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  34.12 
 
 
366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  31.07 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  34.01 
 
 
365 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  32.32 
 
 
366 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  34.56 
 
 
360 aa  174  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  34.01 
 
 
366 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  34.01 
 
 
366 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  34.01 
 
 
366 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  34.01 
 
 
366 aa  174  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  34.01 
 
 
366 aa  174  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  34.01 
 
 
366 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  31.19 
 
 
372 aa  173  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  32.32 
 
 
367 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  29.66 
 
 
364 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  34.01 
 
 
365 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  30.73 
 
 
370 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  32.09 
 
 
364 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  31.81 
 
 
361 aa  172  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  32.4 
 
 
364 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  33.67 
 
 
365 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  35.95 
 
 
395 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  30.29 
 
 
370 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  33.67 
 
 
365 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>