106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1234 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1234  universal stress protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0955  universal stress protein  44.68 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  43.66 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  44.37 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  43.66 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0959  universal stress protein  42.07 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0954  universal stress protein  43.97 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  42.14 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0125  universal stress protein  45.71 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4114  UspA domain protein  41.55 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3927  UspA domain protein  42.25 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4201  UspA domain protein  40.85 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4484  UspA domain protein  40.85 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000133  universal stress protein family 2  43.17 
 
 		 129 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0671042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03344  universal stress global response regulator  40.14 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0220  UspA domain protein  40.14 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3909  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3695  universal stress protein A  40.14 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3977  universal stress protein A  40.14 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0221  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3784  universal stress protein A  40.14 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3827  universal stress protein A  40.14 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3861  universal stress protein A  40.14 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0446526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3904  universal stress protein A  40.14 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3784  universal stress protein A  40.14 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0353489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3794  universal stress protein A  40.14 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3965  universal stress protein A  40.14 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4841  universal stress protein A  40.14 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03297  hypothetical protein  40.14 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4035  universal stress protein A  38.73 
 
 		 148 aa  103  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4090  universal stress protein A  38.73 
 
 		 148 aa  103  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0120  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.792174  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001381  universal stress protein family 8  37.14 
 
 		 189 aa  90.5  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000691396  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  34.72 
 
 		 141 aa  90.1  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06392  hypothetical protein  35.71 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03808  stress-induced protein  36.96 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4062  UspA domain protein  36.96 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  33.57 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000143058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4154  universal stress protein UspD  36.96 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4457  universal stress protein UspD  36.96 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4095  universal stress protein UspD  36.96 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4405  universal stress protein UspD  36.96 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03757  hypothetical protein  36.96 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4363  universal stress protein UspD  36.96 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.54659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5378  universal stress protein UspD  36.96 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2088  universal stress protein UspC  34.97 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0115018  hitchhiker  1.03858e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2082  universal stress protein UspC  34.97 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.025537  decreased coverage  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1194  universal stress protein UspC  34.97 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000126998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1317  universal stress protein UspC  34.97 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  hitchhiker  3.24254e-23 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2143  universal stress protein UspC  34.97 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0567863  hitchhiker  5.63035e-26 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1969  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0857578  hitchhiker  0.00755954 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2632  universal stress protein UspC  31.47 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00097653  hitchhiker  0.0000000000000132668 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01864  universal stress protein  31.47 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.113188  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1747  UspA domain protein  31.47 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17703  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1992  universal stress protein UspC  31.47 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000020089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2127  universal stress protein UspC  31.47 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000153827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1739  universal stress protein UspC  31.47 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.342522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1290  universal stress protein UspC  31.47 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000158426  hitchhiker  0.0000000604455 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01853  hypothetical protein  31.47 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2991  universal stress protein UspC  28.57 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  30.99 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  26.45 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  26.45 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  27.21 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  31.47 
 
 		 149 aa  50.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  29.46 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  27.27 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  32.14 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  27.66 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  24.26 
 
 		 265 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  28.48 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  28.78 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  29.36 
 
 		 271 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  28.48 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  26.49 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  31.58 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  26.45 
 
 		 305 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  29.33 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  26.35 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  27.89 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  53.85 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  51.28 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  27.7 
 
 		 187 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  51.28 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  27.19 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  51.28 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  27.89 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  30.77 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  28.68 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 158 aa  40.8  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  25 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  33.65 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0917  hypothetical protein  26.96 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00440791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  29.46 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2459  hypothetical protein  28.57 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0957833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>