65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2991 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2991  universal stress protein UspC  100 
 
 		 139 aa  286  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764967  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01864  universal stress protein  48.2 
 
 		 142 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.113188  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2127  universal stress protein UspC  48.2 
 
 		 142 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000153827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1739  universal stress protein UspC  48.2 
 
 		 142 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.342522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1992  universal stress protein UspC  48.2 
 
 		 142 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000020089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1290  universal stress protein UspC  48.2 
 
 		 142 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000158426  hitchhiker  0.0000000604455 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01853  hypothetical protein  48.2 
 
 		 142 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.171198  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1747  UspA domain protein  48.2 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2632  universal stress protein UspC  47.48 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00097653  hitchhiker  0.0000000000000132668 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2143  universal stress protein UspC  46.76 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0567863  hitchhiker  5.63035e-26 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1317  universal stress protein UspC  46.76 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  hitchhiker  3.24254e-23 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1194  universal stress protein UspC  46.76 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000126998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2082  universal stress protein UspC  46.76 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.025537  decreased coverage  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2088  universal stress protein UspC  46.76 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0115018  hitchhiker  1.03858e-28 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  43.88 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000143058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3965  universal stress protein A  42.86 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3861  universal stress protein A  42.86 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0446526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3904  universal stress protein A  42.86 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3784  universal stress protein A  42.86 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0353489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3794  universal stress protein A  42.86 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3827  universal stress protein A  42.14 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3784  universal stress protein A  42.14 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4841  universal stress protein A  42.14 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0221  UspA domain-containing protein  42.14 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03297  hypothetical protein  42.14 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03344  universal stress global response regulator  42.14 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3977  universal stress protein A  42.14 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3695  universal stress protein A  42.14 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0220  UspA domain protein  42.14 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4484  UspA domain protein  41.43 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4201  UspA domain protein  41.43 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3927  UspA domain protein  42.14 
 
 		 144 aa  105  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3909  UspA domain-containing protein  41.43 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4114  UspA domain protein  40.71 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  41.43 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4090  universal stress protein A  40 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0120  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.792174  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4035  universal stress protein A  40 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  34.29 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  32.14 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  31.43 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  32.86 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0955  universal stress protein  32.89 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  28.99 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0959  universal stress protein  27.7 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0954  universal stress protein  27.66 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06392  hypothetical protein  28.97 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1234  universal stress protein  28.57 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1969  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0857578  hitchhiker  0.00755954 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001381  universal stress protein family 8  23.57 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000691396  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0125  universal stress protein  28.67 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000133  universal stress protein family 2  28.67 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0671042  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4062  UspA domain protein  25 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5378  universal stress protein UspD  25 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4405  universal stress protein UspD  25 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03808  stress-induced protein  25 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03757  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  22.22 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4363  universal stress protein UspD  25 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.54659 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4095  universal stress protein UspD  25 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4154  universal stress protein UspD  25 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4457  universal stress protein UspD  25 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  22.12 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  22.6 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>