73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001381 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001381  universal stress protein family 8  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000691396  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06392  hypothetical protein  90.21 
 
 		 143 aa  271  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  53.9 
 
 		 141 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  53.9 
 
 		 141 aa  158  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  49.65 
 
 		 141 aa  154  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  45.39 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4114  UspA domain protein  41.84 
 
 		 144 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4035  universal stress protein A  42.55 
 
 		 148 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4090  universal stress protein A  42.55 
 
 		 148 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0120  UspA domain-containing protein  42.55 
 
 		 148 aa  130  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.792174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4484  UspA domain protein  42.55 
 
 		 145 aa  130  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4201  UspA domain protein  42.55 
 
 		 145 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3927  UspA domain protein  43.26 
 
 		 144 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3909  UspA domain-containing protein  43.26 
 
 		 145 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3904  universal stress protein A  43.26 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  41.84 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3861  universal stress protein A  43.26 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0446526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3784  universal stress protein A  43.26 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0353489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3794  universal stress protein A  43.26 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3965  universal stress protein A  43.26 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3784  universal stress protein A  42.55 
 
 		 144 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3827  universal stress protein A  42.55 
 
 		 144 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0221  UspA domain-containing protein  42.55 
 
 		 144 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03344  universal stress global response regulator  42.55 
 
 		 144 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4841  universal stress protein A  42.55 
 
 		 144 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03297  hypothetical protein  42.55 
 
 		 144 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3977  universal stress protein A  42.55 
 
 		 144 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3695  universal stress protein A  42.55 
 
 		 144 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0220  UspA domain protein  42.55 
 
 		 144 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  38.85 
 
 		 141 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0959  universal stress protein  37.16 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0955  universal stress protein  36.62 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0125  universal stress protein  35.46 
 
 		 140 aa  95.9  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1234  universal stress protein  37.14 
 
 		 138 aa  90.5  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1969  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 141 aa  90.1  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0857578  hitchhiker  0.00755954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0954  universal stress protein  31.16 
 
 		 142 aa  85.9  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  32.14 
 
 		 141 aa  85.5  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000143058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1317  universal stress protein UspC  29.29 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  hitchhiker  3.24254e-23 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1194  universal stress protein UspC  29.29 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000126998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2082  universal stress protein UspC  29.29 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.025537  decreased coverage  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2143  universal stress protein UspC  29.29 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0567863  hitchhiker  5.63035e-26 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2088  universal stress protein UspC  29.29 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0115018  hitchhiker  1.03858e-28 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4154  universal stress protein UspD  29.08 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03757  hypothetical protein  29.08 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4062  UspA domain protein  29.08 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03808  stress-induced protein  29.08 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4405  universal stress protein UspD  29.08 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4095  universal stress protein UspD  29.08 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4457  universal stress protein UspD  29.08 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000133  universal stress protein family 2  32.61 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0671042  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4363  universal stress protein UspD  29.08 
 
 		 142 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.54659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5378  universal stress protein UspD  29.08 
 
 		 142 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2632  universal stress protein UspC  28.57 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00097653  hitchhiker  0.0000000000000132668 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01864  universal stress protein  28.57 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.113188  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1290  universal stress protein UspC  28.57 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000158426  hitchhiker  0.0000000604455 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1739  universal stress protein UspC  28.57 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.342522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2127  universal stress protein UspC  28.57 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000153827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1992  universal stress protein UspC  28.57 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000020089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1747  UspA domain protein  28.57 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17703  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01853  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.171198  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  23.78 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2991  universal stress protein UspC  23.57 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  24.11 
 
 		 146 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  21.38 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 146 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  24.29 
 
 		 146 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  24.29 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  22.14 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  24.29 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>