117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0125 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0125  universal stress protein  100 
 
 		 140 aa  275  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0954  universal stress protein  60.99 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0955  universal stress protein  57.45 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0959  universal stress protein  44.59 
 
 		 148 aa  123  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  43.97 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000133  universal stress protein family 2  50.71 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0671042  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  43.88 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  43.88 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3927  UspA domain protein  44.29 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4114  UspA domain protein  42.96 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4035  universal stress protein A  45 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4090  universal stress protein A  45 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0120  UspA domain-containing protein  45 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.792174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3909  UspA domain-containing protein  44.29 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3861  universal stress protein A  43.36 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0446526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3904  universal stress protein A  43.36 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3784  universal stress protein A  43.36 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0353489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3794  universal stress protein A  43.36 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3965  universal stress protein A  43.36 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03344  universal stress global response regulator  43.36 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0220  UspA domain protein  43.36 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4201  UspA domain protein  43.57 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4484  UspA domain protein  43.57 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1234  universal stress protein  45.71 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3695  universal stress protein A  43.36 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3977  universal stress protein A  43.36 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0221  UspA domain-containing protein  43.36 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3784  universal stress protein A  43.36 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03297  hypothetical protein  43.36 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3827  universal stress protein A  43.36 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4841  universal stress protein A  43.36 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  42.66 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  40.14 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  39.29 
 
 		 141 aa  95.9  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001381  universal stress protein family 8  35.46 
 
 		 189 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000691396  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06392  hypothetical protein  36.88 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1969  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0857578  hitchhiker  0.00755954 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03808  stress-induced protein  34.97 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4062  UspA domain protein  34.97 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03757  hypothetical protein  34.97 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4154  universal stress protein UspD  34.97 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4457  universal stress protein UspD  34.97 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4095  universal stress protein UspD  34.97 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4363  universal stress protein UspD  34.97 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.54659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5378  universal stress protein UspD  34.97 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4405  universal stress protein UspD  34.97 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  34.97 
 
 		 141 aa  76.6  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000143058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2088  universal stress protein UspC  32.17 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0115018  hitchhiker  1.03858e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2082  universal stress protein UspC  32.17 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.025537  decreased coverage  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1194  universal stress protein UspC  32.17 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000126998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1317  universal stress protein UspC  32.17 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  hitchhiker  3.24254e-23 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2143  universal stress protein UspC  32.17 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0567863  hitchhiker  5.63035e-26 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2632  universal stress protein UspC  32.17 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00097653  hitchhiker  0.0000000000000132668 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01864  universal stress protein  32.17 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.113188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01853  hypothetical protein  32.17 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1992  universal stress protein UspC  32.17 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000020089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2127  universal stress protein UspC  32.17 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000153827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1739  universal stress protein UspC  32.17 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.342522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1290  universal stress protein UspC  32.17 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000158426  hitchhiker  0.0000000604455 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1747  UspA domain protein  32.17 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2991  universal stress protein UspC  28.67 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  28.47 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  29.93 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  29.93 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  28.57 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  27.52 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  28.26 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.78 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  29.93 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 291 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.99 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  32.41 
 
 		 309 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  28.19 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  24.65 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  30.67 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  30.2 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  28.37 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 291 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  28.03 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  31.78 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  28.39 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  48.72 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  28.38 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  30.07 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  28.39 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  27.13 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  28.37 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  28.37 
 
 		 143 aa  42.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1446  universal stress protein UspA  26.55 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  26.52 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  26.72 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  29.05 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  27.86 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>