89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0959 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0959  universal stress protein  100 
 
 		 148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0955  universal stress protein  46.9 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0954  universal stress protein  44.9 
 
 		 142 aa  133  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  42.18 
 
 		 141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  42.18 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  44.9 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0125  universal stress protein  44.59 
 
 		 140 aa  123  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  42.18 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4114  UspA domain protein  41.38 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1234  universal stress protein  42.07 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3909  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3827  universal stress protein A  39.46 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3784  universal stress protein A  39.46 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0221  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3977  universal stress protein A  39.46 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3695  universal stress protein A  39.46 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4841  universal stress protein A  39.46 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3927  UspA domain protein  39.46 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03297  hypothetical protein  39.46 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4484  UspA domain protein  38.78 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03344  universal stress global response regulator  39.46 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0220  UspA domain protein  39.46 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4201  UspA domain protein  38.78 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3965  universal stress protein A  38.78 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3794  universal stress protein A  38.78 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3784  universal stress protein A  38.78 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0353489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3904  universal stress protein A  38.78 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3861  universal stress protein A  38.78 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0446526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001381  universal stress protein family 8  37.16 
 
 		 189 aa  110  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000691396  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000133  universal stress protein family 2  40.82 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0671042  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06392  hypothetical protein  37.16 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0120  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.792174  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4090  universal stress protein A  38.1 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4035  universal stress protein A  38.1 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  34.46 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000143058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  32.87 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1317  universal stress protein UspC  35.14 
 
 		 142 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  hitchhiker  3.24254e-23 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1194  universal stress protein UspC  35.14 
 
 		 142 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000126998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2082  universal stress protein UspC  35.14 
 
 		 142 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.025537  decreased coverage  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2088  universal stress protein UspC  35.14 
 
 		 142 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0115018  hitchhiker  1.03858e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2143  universal stress protein UspC  35.14 
 
 		 142 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0567863  hitchhiker  5.63035e-26 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2632  universal stress protein UspC  31.51 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00097653  hitchhiker  0.0000000000000132668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1969  UspA domain-containing protein  23.78 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0857578  hitchhiker  0.00755954 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1739  universal stress protein UspC  30.82 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.342522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1290  universal stress protein UspC  30.82 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000158426  hitchhiker  0.0000000604455 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01853  hypothetical protein  30.82 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.171198  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01864  universal stress protein  30.82 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.113188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1992  universal stress protein UspC  30.82 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000020089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2127  universal stress protein UspC  30.82 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000153827  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1747  UspA domain protein  30.82 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17703  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4457  universal stress protein UspD  28.57 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03808  stress-induced protein  28.57 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03757  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4062  UspA domain protein  28.57 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4154  universal stress protein UspD  28.57 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4095  universal stress protein UspD  28.57 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4405  universal stress protein UspD  28.57 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5378  universal stress protein UspD  28.57 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4363  universal stress protein UspD  28.57 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.54659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2991  universal stress protein UspC  27.7 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  29.93 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  28 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  29.33 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  28.67 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  27.21 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  28.21 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  24.49 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  24.84 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  27.33 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  26.32 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  27.97 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  23.9 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  26.67 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  26.67 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  26.53 
 
 		 294 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  23.65 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1649  UspA domain-containing protein  23.29 
 
 		 305 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 151 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  22.97 
 
 		 145 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  26.45 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1446  universal stress protein UspA  26.89 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>